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脑部细胞基因表达谱分析技术

目录

文档概括................................................4

1.1研究背景与意义.........................................5

1.2脑部细胞组学概述.......................................6

1.3基因表达谱分析技术简介.................................8

脑部细胞采集与制备技术.................................11

2.1样本获取方法学........................................12

2.1.1尸脑样本采集规范....................................18

2.1.2脑组织活检技术......................................20

2.2细胞分离与鉴定方法....................................21

2.2.1机械/物理法分离技术.................................23

2.2.2密度梯度离心法应用..................................26

2.2.3细胞表面标记介导纯化................................29

2.2.4单细胞分离新进展....................................30

基因转录组捕获策略.....................................32

3.1RNA提取与质量控制....................................35

3.1.1总RNA提取方案比较.................................36

3.1.2RNA完整性与纯度评估................................39

3.2基因组范围............................................42

3.2.1全基因组oligo......................................44

3.2.2关键步骤流程........................................46

基因表达谱测序技术.....................................51

4.1高通量测序方法学......................................54

4.1.1基于捕获的测序方案..................................56

4.1.2直接RNA测序技术(如RNASeq).......................57

4.1.3Poolbygene技术途径................................62

4.2测序数据质控与准备....................................64

4.2.1原始数据质量评估标准................................67

4.2.2显著性降低与适配体去除..............................70

4.2.3去宿主污染处理......................................72

基因表达数据分析流程...................................73

5.1数据序列比对与格式转换................................74

5.2表达矩阵构建与归一化处理..............................79

5.2.1基本计数矩阵生成....................................80

5.2.2归一化方法选择与应用................................81

5.3差异表达分析方法......................................83

5.3.1统计显著性检验模型..................................86

5.3.2多层次筛选标准......................................88

5.4微阵列标准化方法.................................

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