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脑部细胞基因表达谱分析技术
目录
文档概括................................................4
1.1研究背景与意义.........................................5
1.2脑部细胞组学概述.......................................6
1.3基因表达谱分析技术简介.................................8
脑部细胞采集与制备技术.................................11
2.1样本获取方法学........................................12
2.1.1尸脑样本采集规范....................................18
2.1.2脑组织活检技术......................................20
2.2细胞分离与鉴定方法....................................21
2.2.1机械/物理法分离技术.................................23
2.2.2密度梯度离心法应用..................................26
2.2.3细胞表面标记介导纯化................................29
2.2.4单细胞分离新进展....................................30
基因转录组捕获策略.....................................32
3.1RNA提取与质量控制....................................35
3.1.1总RNA提取方案比较.................................36
3.1.2RNA完整性与纯度评估................................39
3.2基因组范围............................................42
3.2.1全基因组oligo......................................44
3.2.2关键步骤流程........................................46
基因表达谱测序技术.....................................51
4.1高通量测序方法学......................................54
4.1.1基于捕获的测序方案..................................56
4.1.2直接RNA测序技术(如RNASeq).......................57
4.1.3Poolbygene技术途径................................62
4.2测序数据质控与准备....................................64
4.2.1原始数据质量评估标准................................67
4.2.2显著性降低与适配体去除..............................70
4.2.3去宿主污染处理......................................72
基因表达数据分析流程...................................73
5.1数据序列比对与格式转换................................74
5.2表达矩阵构建与归一化处理..............................79
5.2.1基本计数矩阵生成....................................80
5.2.2归一化方法选择与应用................................81
5.3差异表达分析方法......................................83
5.3.1统计显著性检验模型..................................86
5.3.2多层次筛选标准......................................88
5.4微阵列标准化方法.................................
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