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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个工具常用于测序数据的质量控制?
A.BWA
B.FastQC
C.GATK
D.Salmon
答案:B
解析:FastQC是专门用于评估测序数据质量的工具,可生成质量分布、GC含量等报告;BWA(序列比对)、GATK(变异检测)、Salmon(转录本定量)均不用于质量控制,因此选B。
人类基因组数据库Ensembl的主要特点是?
A.专注于模式生物的功能注释
B.提供基因表达谱数据
C.整合基因组、转录组和蛋白质组注释
D.仅存储SNP变异信息
答案:C
解析:Ensembl是综合基因组数据库,整合了基因组序列、基因结构、调控元件等多维度注释;A为FlyBase等模式生物数据库特点,B为GEO等表达数据库功能,D为dbSNP特点,故选C。
下列哪项是二代测序(NGS)的典型特征?
A.读长超过10kb
B.单分子实时测序
C.高通量短读长(50-300bp)
D.无需PCR扩增
答案:C
解析:NGS以短读长(通常50-300bp)和高通量为特征;A、B、D均为三代测序(如PacBio、Nanopore)的特点,因此选C。
RNA-seq中“FPKM”指标用于衡量?
A.基因的剪接变体数量
B.基因的表达丰度
C.测序数据的错误率
D.基因组的重复序列比例
答案:B
解析:FPKM(每百万映射reads的外显子每千碱基片段数)是标准化后的基因表达量计算指标;A为可变剪接分析内容,C为质量控制指标,D为基因组组成分析内容,故选B。
序列比对算法BLAST的主要用途是?
A.预测蛋白质三维结构
B.查找相似性序列
C.组装基因组片段
D.检测拷贝数变异
答案:B
解析:BLAST(基本局部比对搜索工具)用于在数据库中查找与查询序列相似的序列;A为AlphaFold等工具功能,C为SPAdes等组装工具功能,D为CNVnator等工具功能,因此选B。
以下哪种变异类型通常不通过GATK检测?
A.SNP(单核苷酸多态性)
B.Indel(插入缺失)
C.结构变异(SV)
D.点突变(PointMutation)
答案:C
解析:GATK主要用于检测小变异(SNP、Indel、点突变),结构变异(如倒位、易位)需通过Pindel、Delly等工具检测,因此选C。
单细胞RNA-seq中“dropout”现象指?
A.测序数据的高错误率
B.基因表达的随机丢失(未检测到低丰度转录本)
C.细胞群体的污染
D.测序读长的不均匀分布
答案:B
解析:Dropout是单细胞测序中因mRNA捕获效率低,导致低表达基因未被检测到的现象;A为测序技术本身的误差,C为实验操作问题,D为数据分布特征,故选B。
蛋白质互作网络分析常用的数据库是?
A.STRING
B.UniProt
C.PDB
D.KEGG
答案:A
解析:STRING数据库整合了已知和预测的蛋白质相互作用信息;UniProt是蛋白质序列数据库,PDB是蛋白质结构数据库,KEGG是通路数据库,因此选A。
以下哪个步骤不属于ChIP-seq数据分析流程?
A.峰调用(PeakCalling)
B.差异表达基因筛选
motif分析
D.富集到基因组区域(如启动子)
答案:B
解析:ChIP-seq用于研究蛋白与DNA的结合,流程包括比对、峰调用、motif分析、区域富集;差异表达筛选是RNA-seq的步骤,因此选B。
用于评估基因组组装质量的指标是?
A.N50
B.FPKM
C.Q30
D.MAPQ
答案:A
解析:N50是组装连续性的关键指标(一半组装序列长度≥N50);FPKM是表达量,Q30是测序质量,MAPQ是比对质量,因此选A。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于NGS数据预处理步骤的有?
A.去除接头序列(AdapterTrimming)
B.质量过滤(QualityFiltering)
C.序列比对(Mapping)
D.定量分析(Quantification)
答案:AB
解析:预处理指测序后、比对前的处理,包括去接头(A)和质量过滤(B);比对(C)和定量(D)属于后续分析步骤,因此选AB。
差异表达基因分析常用的工具包括?
A.DESeq2
B.edgeR
C.limma
D.BWA
答案:ABC
解析:DESeq2、edgeR(适用于计数数据)和limma(结合voom转换)均为差异表达分析工具;BWA是比对工具,因此选ABC。
基因组注释的主要内容包括?
A.基因结构预测(外显子-内含子边界)
B.非编码RNA注释(如miRNA)
C
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