2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在转录组学中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在转录组学中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.下列哪一项*不是*RNA-Seq技术能够提供的信息？

A.基因表达的丰度

B.基因的转录起始位点

C.mRNA的剪接异构体

D.蛋白的翻译后修饰

2.在RNA-Seq数据分析流程中，去除适配器序列和低质量读段通常发生在哪个阶段？

A.对齐到参考基因组之前

B.差异表达分析之前

C.转录本定量之前

D.数据归一化之后

3.以下哪种工具通常用于将RNA-Seq读段对齐到参考基因组或转录组注释文件？

A.DESeq2

B.HISAT2

C.GSEA

D.KOBAS

4.在进行差异表达基因分析时，假设检验中的“假发现率”（FDR）指的是什么？

A.真正差异表达基因总数

B.在所有显著差异基因中，错误发现为差异表达基因的比例

C.真正非差异表达基因总数

D.分析中产生的总读段数

5.以下哪个数据库是存储和检索基因表达谱数据（如GEO系列数据集）的主要公共平台？

A.Ensembl

B.NCBISRA

C.GeneOntology(GO)

D.GEO

6.基因集富集分析（GSEA）与传统的基因列表富集分析（如GEO2R）相比，其主要优势是什么？

A.只能分析KEGG通路

B.可以评估基因列表中通路富集的统计显著性，不受基因列表大小影响

C.必须使用特定的R语言包

D.只能分析蛋白质-蛋白质相互作用网络

7.当比较两种处理条件（如药物处理vs.对照）的转录组时，确定哪些基因在统计上显著地改变了表达水平，这个分析步骤通常称为？

A.本征值分解(PCA)

B.主成分分析(PCA)

C.差异表达分析

D.基因集富集分析

8.RNA-Seq数据预处理过程中，过滤低质量读段主要是为了去除哪些类型的读段？

A.与参考基因组有多个匹配位置的读段

B.含有过多未知碱基（N）或接头的读段

C.长度符合预期范围的读段

D.来源于rRNA的读段

9.以下哪个参数是评估RNA-Seq数据质量时常用的指标？

A.基因数量(GeneCount)

B.读段总数(TotalReads)

C.RIN值(ReadsperIntervalNumber)

D.FDR值(FalseDiscoveryRate)

10.对于长链非编码RNA（lncRNA）的研究，RNA-Seq分析相较于传统基因表达分析方法（如Northernblot）有哪些优势？

A.只能检测已知lncRNA

B.无法检测lncRNA的剪接异构体

C.能够发现新的lncRNA并研究其表达模式

D.对样本量要求更大

二、填空题（每空2分，共20分）

1.RNA-Seq技术的全称是________sequencing，它通过测序样本中的________来研究基因表达。

2.RNA-Seq数据分析中，对齐后的读段通常需要转换为________进行定量，以便计算每个基因或转录本的表达水平。

3.差异表达分析常用的统计模型包括________和________。

4.常用的读段对齐工具________和________都可以用于RNA-Seq数据的比对。

5.用于评估基因功能或通路富集情况的在线数据库或工具，如________和________。

6.在RNA-Seq实验设计中，为了控制技术变异，通常需要设置________组。

7.RNA-Seq数据预处理阶段，除了过滤低质量读段，还需要进行________的去除。

8.归一化是RNA-Seq数据分析中的重要步骤，目的是消除________和________等因素对表达水平的影响。

9.转录组学研究的核心目标是理解在不同条件下________的动态变化。

10.除了mRNA，真核生物转录组还包含多种RNA分子，如________、_______和________。

三、简答题（每题5分，共15分）

1.简述RNA-Seq数据分析的主要流程，并说明每个阶段的主要任务。

2.解释什么是假发现率（FDR），为