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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在农业基因改良中的应用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.在农业基因改良中,用于鉴定目标基因或寻找同源基因的生物信息学工具主要是?
A.基因表达谱芯片分析软件
B.蛋白质结构预测服务器
C.基因组浏览器
D.序列比对工具(如BLAST)
2.对农业转录组数据进行差异表达基因分析,最常用的统计模型或软件包是?
A.ClustalW
B.BLAST
C.DESeq2或EdgeR
D.Swiss-Model
3.GO富集分析在农业基因改良中的主要作用是?
A.预测基因编码的蛋白质功能
B.比较不同基因组的序列相似性
C.确定基因表达的时间模式
D.评估基因组中基因密度的分布
4.基因组选择(GenomicSelection)技术在农业育种中主要应用于?
A.直接克隆目标性状基因
B.鉴定病原体基因组
C.提高育种选择的准确性,加速复杂性状改良
D.预测个体基因组的整体功能
5.下列哪个数据库最常被用于查询植物、动物和微生物的基因组序列信息?
A.NCBIGenBank
B.UniProt
C.PDB
D.GO
6.如果想分析某个基因在不同组织或发育阶段的表达模式,最适合使用的生物信息学方法是?
A.基因组拼接
B.变异检测
C.转录组序列分析
D.蛋白质结构域预测
7.在利用生物信息学进行抗病基因挖掘时,通常不会利用到?
A.病原体和寄主基因组的序列比对
B.抗病相关基因家族的保守结构域分析
C.基于群体遗传学的选择信号检测
D.蛋白质功能域的预测
8.KEGG数据库在农业生物信息学中主要用于?
A.存储大规模基因组序列数据
B.提供基因和蛋白质的序列和结构信息
C.整合基因功能注释和代谢通路信息
D.分析基因表达的时间序列数据
9.将生物信息学分析结果(如基因列表)与公共数据库信息关联起来,以获得生物学解释的过程称为?
A.序列比对
B.数据库检索与整合
C.生物序列注释
D.聚类分析
10.生物信息学在农业性状改良中面临的主要挑战之一是?
A.农业基因组数据缺乏
B.软件和数据库使用过于简单
C.复杂性状的遗传基础和环境影响难以解析
D.基因编辑技术成本过高
二、填空题(每空2分,共20分)
1.生物信息学通过分析生物数据的模式来揭示生命过程的规律,其核心包括获取、存储、分析和解释生物数据。
2.在农业研究中,高通量测序技术产生的转录组数据(RNA-Seq)是进行基因表达分析的重要资源。
3.利用生物信息学方法,可以从基因组序列中识别出具有潜在功能的基因,这一过程通常称为基因。
4.为了研究基因的功能,常常将其与已知功能的基因进行序列比对,寻找同源基因,这利用了生物序列的原理。
5.功能注释是将基因或蛋白质与已知的生物学功能、过程或通路联系起来,常用的数据库包括GO和KEGG。
6.基因组选择技术利用全基因组标记信息来预测个体遗传价值,从而加速复杂性状的育种进程。
7.在农业基因改良研究中,数据库不仅是数据存储的地方,也是获取基因注释、序列信息和研究文献的重要资源。
8.基于生物信息学的分子标记辅助选择(MAS)是传统育种与现代生物技术结合的重要应用。
9.分析比较不同品种在特定胁迫下的基因表达谱,有助于发掘与抗逆性相关的候选基因。
10.随着测序技术的快速发展,生物信息学在农业基因改良中的作用日益凸显,但也对数据存储和计算能力提出了更高的要求。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述利用生物信息学进行新基因发掘通常包含哪些主要步骤。
2.简述转录组测序数据(RNA-Seq)分析在农业研究中的主要应用方向。
3.简述生物信息学在农业抗病育种中发挥作用的主要途径。
4.简述在农业基因改良项目中,选择合适的生物信息学工具或数据库时需要考虑哪些因素。
四、分析与应用题(每题10分,共30分)
1.假设你正在参与一项旨在提高玉米抗旱性的研究。请简述你会如何利用生物信息学资源来寻找潜在的候选抗旱基因?请列出主要步骤和可能使用的工具或数据库类型。
2.某研究团队公布了一项利用RNA-Seq数据鉴定小
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