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RAPD和SSR技术解析茄子种质资源遗传多样性

一、引言

1.1研究背景与意义

茄子（SolanummelongenaL.）作为全球广泛种植的重要蔬菜作物之一，在蔬菜产业中占据着举足轻重的地位。其丰富的营养价值和多样的烹饪方式，深受消费者喜爱，市场需求持续增长。据统计，亚洲作为茄子的主要栽培区域，产量占世界总产量的74%左右，而中国作为茄子的第二起源地，栽培历史悠久，类型品种繁多，是世界上最大的茄子生产国，种植面积和产量均居世界首位。

种质资源遗传多样性是物种生存、进化和适应环境变化的基础，对于茄子的育种和品种改良具有不可替代的重要性。深入研究茄子种质资源遗传多样性，能够全面了解茄子的遗传背景和进化历程，为茄子的品种选育提供丰富的遗传材料，从而培育出更多高产、优质、抗病、抗逆的茄子新品种，满足日益增长的市场需求，推动蔬菜产业的可持续发展。同时，遗传多样性研究还有助于保护和利用茄子的野生近缘种和地方品种，避免遗传资源的流失，维护生态平衡和生物多样性。

1.2茄子种质资源概述

茄子原产于亚洲南部热带地区，古印度被认为是最早的驯化地，至今印度仍存有茄子的野生种和近缘种。随着时间的推移，茄子逐渐传播到世界各地。其传播路线推测为：4-5世纪从印度传入中国，7-8世纪由中国传至日本，13世纪传入欧洲，17世纪在欧洲广泛传播后传入美洲。

中国作为茄子的次生起源中心，拥有极为丰富的茄子种质资源。不同地域的生态环境和消费习惯差异，造就了各具特色的地方品种。目前，国家蔬菜种质资源中期库保存的茄子及其近缘野生种资源已达1601份。从地理分布来看，东北、华东、华南地区主要栽培长茄，华北、西北地区则以圆茄种植为主。例如，东北地区的绿茄，果实呈长棒形，果皮鲜绿色，肉质紧密，口感鲜美；华北地区的北京大红袍圆茄，果实硕大，呈扁圆形，果皮紫红色，品质优良，深受当地消费者喜爱。这些丰富多样的茄子种质资源，为我国茄子的遗传育种和品种改良提供了坚实的物质基础。

1.3RAPD和SSR技术原理及在植物遗传多样性研究中的应用

随机扩增多态性DNA（RandomAmplifiedPolymorphicDNA，RAPD）技术，是1990年由Williams和Welsh等人建立的一种基于PCR的分子标记技术。其原理是利用一个随机的短引物（通常为10个碱基对），在较低的退火温度下与基因组DNA进行随机配对，通过PCR扩增基因组DNA，产生多态性片段。由于不同个体的基因组DNA序列存在差异，引物结合位点和扩增片段长度也会有所不同，从而产生多态性。RAPD技术操作简便、快速，成本低廉，无需预先了解物种的基因组信息，在植物遗传多样性分析、种质资源鉴定、亲缘关系分析等方面得到了广泛应用。例如，在对茄子种质资源的研究中，通过RAPD标记分析，可以快速了解不同种质之间的遗传差异，为种质资源的分类和评价提供依据。然而，RAPD技术也存在一些局限性，如结果重复性较差，易受实验条件影响，扩增片段的遗传信息不明确等。

简单序列重复（SimpleSequenceRepeat，SSR），又称微卫星DNA，是指在基因组中由1-6个核苷酸组成的简单重复序列，如(GA)n、(AC)n、(GAA)n等，其中n为重复次数，一般在10-50之间。SSR标记技术的原理是基于SSR序列两端的保守侧翼序列设计特异性引物，通过PCR扩增SSR位点，由于不同个体中SSR重复次数的差异，扩增产物的长度也会不同，从而表现出多态性。SSR标记具有多态性高、共显性遗传、分布广泛、稳定性好、重复性高、遗传信息量大等优点，并且每个位点由设计的引物顺序决定，便于合作交流开发引物。在植物遗传多样性研究中，SSR标记被广泛应用于遗传图谱构建、基因定位、品种鉴定、遗传多样性分析、亲缘关系分析等领域。例如，利用SSR标记可以准确地分析茄子种质资源的遗传多样性，明确不同种质之间的亲缘关系，为茄子的育种工作提供重要的遗传信息。

1.4研究目的与内容

本研究旨在利用RAPD和SSR技术，对茄子种质资源进行全面、深入的遗传多样性分析，揭示不同茄子种质之间的遗传差异和亲缘关系，为茄子的遗传育种和品种改良提供科学依据和理论支持。

具体研究内容包括：收集不同来源的茄子种质资源，构建丰富的实验材料库；运用RAPD技术对茄子种质资源进行遗传多样性分析，筛选出具有多态性的引物，扩增出多态性片段，并对扩增结果进行统计分析，计算遗传相似系数和遗传距离，构建聚类图谱，了解种质资源的遗传结构和分类情况；运用SSR技术对茄子种质资源进行遗传多样性分析，筛选出多态性高的SSR引物，扩增出SSR