2025年大学《生物信息学》专业题库—— 免疫新药临床评估和生物信息学法.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——免疫新药临床评估和生物信息学法

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、

简述免疫检查点抑制剂（如PD-1/PD-L1抑制剂）作用的基本原理，并说明其治疗肿瘤时可能引发的特殊类型不良事件（irAEs）及其主要特点。

二、

在免疫新药的临床评估中，与传统小分子靶向药物相比，通常需要关注哪些独特的疗效评估指标和标准？请列举并简述其含义及原因。

三、

生物标志物在免疫新药的临床研发和个体化治疗中扮演着重要角色。请列举至少三种与免疫治疗疗效相关的潜在生物标志物，并分别说明其基本概念及其预测疗效的潜在机制。

四、

描述一下从高通量测序数据（例如RNA-seq）获取肿瘤样本基因表达谱，到进行差异表达基因分析以筛选潜在治疗靶点或生物标志物的基本生物信息学流程。请提及关键的质控、标准化和统计分析步骤。

五、

肿瘤免疫微环境（TME）对肿瘤的发生发展和免疫治疗的响应至关重要。请简述利用生物信息学方法（如特定算法或数据库查询）分析肿瘤样本基因表达数据以评估TME组成（例如免疫细胞浸润情况）的基本思路，并提及至少两种常用的免疫细胞浸润分析相关的指标或方法。

六、

机器学习（ML）和深度学习（DL）技术在预测免疫治疗反应方面显示出巨大潜力。请简述利用这些技术预测患者对免疫治疗反应的基本原理，并讨论在构建和应用此类预测模型时需要考虑的关键因素和潜在的挑战。

七、

在进行免疫治疗相关的生物信息学分析时，数据整合（整合多组学数据，如基因表达、甲基化、免疫细胞浸润特征等）是一个重要的研究方向。请说明进行数据整合的主要目的，并简述一种可能的数据整合策略或分析方法。

八、

生物信息学分析结果的解读需要结合生物学背景和临床意义。请以一个假设性的分析结果为例（例如，发现某基因集与免疫治疗疗效显著相关），说明如何从生物信息学角度深入解读该结果，并探讨其可能具有的临床转化价值。

九、

在利用生物信息学方法分析涉及人类基因组数据的免疫新药相关研究时，应如何关注并处理数据隐私和伦理问题？请提出至少两点相关的原则或措施。

试卷答案

一、

免疫检查点抑制剂（如PD-1/PD-L1抑制剂）作用的基本原理是阻断肿瘤细胞表面或肿瘤浸润免疫细胞表面的检查点分子（如PD-1/PD-L1）与其在免疫细胞表面表达的配体（如PD-L1）的结合。这种结合通常会抑制T细胞的活性，从而抑制抗肿瘤免疫反应。PD-1/PD-L1抑制剂通过阻断这一相互作用，解除对T细胞的抑制，从而恢复或增强抗肿瘤免疫，进而杀伤肿瘤细胞。

其治疗肿瘤时可能引发的特殊类型不良事件（irAEs）主要是由于免疫反应过于强烈或攻击了自身正常组织。主要特点包括：1）可发生在身体的多个器官系统，如皮肤、肠道、肝脏、内分泌腺体（甲状腺、垂体等）、肺等；2）症状可能从轻微到严重，甚至危及生命；3）发生机制通常与自身免疫反应攻击表达特定抗原的自身组织有关；4）治疗往往需要根据受累器官和严重程度使用糖皮质激素等免疫抑制剂。

二、

免疫新药（特别是免疫检查点抑制剂）的临床评估通常需要关注以下独特的疗效评估指标和标准：

1）客观缓解率（ObjectiveResponseRate,ORR）：指治疗结束后，完全缓解（CR）和部分缓解（PR）患者占所有可评估疗效患者总数的百分比。免疫治疗的缓解往往持续时间较长，ORR是评估其疗效的重要指标，但可能无法完全捕捉到缓解的持久性。

2）无进展生存期（Progression-FreeSurvival,PFS）：指从治疗开始到肿瘤进展或死亡的时间。由于免疫治疗的缓解通常较慢且持久，PFS成为评估免疫治疗疗效的关键指标，能更好地反映治疗对肿瘤进展的抑制效果。

3）总生存期（OverallSurvival,OS）：指从治疗开始到患者死亡的时间。OS是衡量治疗最终效果和患者生存获益的最重要指标，尤其对于预期生存期较长的癌症类型，OS是决定治疗成功与否的核心终点。

4）免疫相关缓解（Immune-RelatedResponse,iResponse）：包括免疫相关完全缓解（irCR）和免疫相关部分缓解（irPR），其评估标准更关注肿瘤对免疫治疗的独特反应模式，如肿瘤缩小与特定免疫浸润模式改变相关、或在原有进展灶出现缩小等。irRECIST（免疫相关RECIST）是相应的评估标准，旨在更准确地评估免疫治疗的疗效，克服传统RECIST标准对免疫治疗反应评估的局限性。

与传统小分子靶向药物相比，免疫治疗的效果通常出现较晚（“延迟效应”），且缓解更持久，因此更侧重于评估缓解的持久性（PFS、OS）和独特的缓解模式（ORR、iResponse），而不仅仅是肿瘤大小的短期变化。

三、

与免疫治疗疗效相关的潜在生物标志物有多