2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学与细胞信号通路的整合研究.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学与细胞信号通路的整合研究

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分。请将正确选项的代表字母填写在答题纸上。）

1.在研究细胞信号通路时，以下哪个数据库最常用于存储和查询蛋白质的3D结构信息？

A.GeneBank

B.UniProt

C.PDB

D.GEO

2.当研究人员获得了某种细胞在不同刺激下的基因表达谱数据（如RNA-Seq数据），他们通常会使用哪种生物信息学方法来识别在特定信号通路中显著上调或下调的基因集？

A.基因序列比对

B.蛋白质结构域预测

C.通路富集分析（如GO或KEGG分析）

D.DNA序列重复性分析

3.PhosphoSiteDB和Reactome这两个数据库在研究细胞信号通路时各具有什么主要作用？

A.PhosphoSiteDB存储蛋白质修饰信息，Reactome存储通路注释信息

B.两者都主要用于存储完整的基因组序列

C.PhosphoSiteDB用于预测蛋白质结构，Reactome用于基因表达分析

D.两者都主要用于绘制蛋白质之间的直接相互作用网络

4.基于蛋白质序列的同源性搜索（如使用BLAST），主要能够帮助研究人员推断什么信息？

A.蛋白质的二级结构

B.蛋白质亚细胞定位

C.蛋白质之间的功能或结构相似性

D.蛋白质修饰位点的精确位置

5.在构建细胞信号通路网络时，除了蛋白质与蛋白质的相互作用，通常还会考虑哪些重要的网络元素？

A.基因表达调控元件（如转录因子）

B.蛋白质丰度数据

C.蛋白质二级结构信息

D.脱氧核糖核酸（DNA）序列

6.机器学习算法在细胞信号通路研究中一个重要的应用是？

A.直接进行蛋白质结晶实验

B.自动从海量生物文本数据中挖掘通路相关信息

C.完全自动化地执行所有生物信息学分析流程

D.精确预测每个基因在所有细胞类型中的表达量

7.单细胞测序技术（如scRNA-Seq）在研究细胞信号通路方面的主要优势在于什么？

A.能够提供整个生物体的基因表达平均值

B.可以揭示细胞群体内由于信号通路激活程度不同而产生的细胞异质性

C.只能检测到高丰度的蛋白质编码基因

D.产生的数据量远小于传统BulkRNA-Seq

8.将蛋白质组学数据（如磷酸化蛋白质列表）与蛋白质结构信息整合分析，主要目的是什么？

A.仅用于预测蛋白质的一级结构

B.为了比较不同物种的蛋白质序列差异

C.帮助定位关键信号转导位点和理解信号传递机制

D.用于评估蛋白质的稳定性

9.反向蛋白质组学（ReverseProteomics）在细胞信号通路研究中的核心目标是？

A.从蛋白质序列推断其基因序列

B.通过鉴定修饰的蛋白质及其位点来研究信号事件

C.测量所有蛋白质的绝对丰度

D.构建蛋白质之间的直接相互作用图

10.整合不同来源和类型的数据（如基因表达、蛋白质修饰、互作网络）进行系统分析，这种方法最能体现生物信息学与细胞信号通路研究结合的什么特点？

A.简单性

B.线性化

C.复杂性与系统思维

D.绝对精确性

二、填空题（每空2分，共20分。请将答案填写在答题纸上。）

1.生物信息学研究中常用的GO（GeneOntology）数据库提供了关于基因和蛋白质的______、______和______方面的信息。

2.KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes）数据库不仅包含通路信息，还提供了大量的______和______数据。

3.利用公共数据库（如PhosphoSiteDB）和生物信息学工具分析蛋白质磷酸化位点，对于理解细胞信号转导的______和______至关重要。

4.在进行通路分析时，除了统计显著性，还需要考虑通路中______的富集程度，以评估通路参与的强度。

5.将实验数据（如基因表达变化）与计算预测（如通路模拟）相结合，可以更全面地______和______细胞信号通路的活动规律。

6.系统生物学网络分析中，节点通常代表______或______，边代表它们之间的相互作用或调控关系。

7.机器学习模型在预测信号通路中蛋白质的功能或相互作用方面，可以利用大量的_____