2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学在功能基因组学中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在功能基因组学中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.功能基因组学的主要研究目标是？

A.测序基因组DNA序列

B.阐明基因的功能及其调控机制

C.构建基因组物理图谱

D.研究基因组的进化历程

2.在进行基因功能注释时，以下哪项工具主要用于在蛋白质水平上寻找同源蛋白？

A.BLASTp

B.HMMER

C.GOseq

D.DAVID

3.GO富集分析主要用于什么？

A.比较两个基因组的大小

B.预测单个基因的功能

C.确定基因集在某个生物学过程或功能类别中的富集程度

D.寻找基因之间的物理相互作用

4.RNA-Seq数据分析的第一步通常是什么？

A.差异表达基因筛选

B.转录本定量

C.序列比对到参考基因组

D.通路富集分析

5.KEGG数据库中，哪个部分主要描述了分子功能的层次结构？

A.PATHWAY

B.DRUG

C.BRITE

D.GENOME

6.预测基因启动子区域转录因子结合位点的常用工具是？

A.BLAST

B.MEMEsuite

C.Cufflinks

D.DAVID

7.蛋白质互作网络（PPI）分析中，STRING数据库的主要优势是什么？

A.仅基于实验数据

B.仅基于计算预测

C.整合了实验和计算数据，并提供网络评分

D.只适用于特定物种

8.在生物信息学分析中，FDR通常代表什么？

A.FalseDiscoveryRate，即错误发现率

B.FalsePositiveRate，即假阳性率

C.FalseNegativeRate，即假阴性率

D.FishersExactTestRate，即费希尔精确检验率

9.以下哪项技术通常不直接用于功能基因组学研究，而是用于测定基因组DNA序列的物理结构？

A.ChIP-seq

B.Next-GenerationSequencing(NGS)

C.SouthernBlotting

D.RNA-Seq

10.解释一个复杂的生物信息学分析结果时，什么能力最为关键？

A.编写代码的能力

B.操作高性能计算集群的能力

C.将分析结果与生物学背景知识相结合进行解读的能力

D.熟悉各种数据库的搜索技巧

二、填空题（每空1分，共15分）

1.利用BLAST比对基因序列，可以通过寻找______基因来推断其潜在功能。

2.GO数据库包含三个主要部分：______、______和______。

3.RNA-Seq实验中，通常需要将原始测序读数（RawReads）经过______、______和______等步骤进行处理，才能进行后续分析。

4.差异表达基因分析中，FoldChange衡量的是基因表达的______，而FDR衡量的是______。

5.转录因子结合位点（TFBS）通常位于基因的______区域。

6.KEGGPATHWAY数据库提供了大量关于______、______和______的通路信息。

7.在构建蛋白质互作网络时，节点通常代表______，边代表______。

8.为了评估RNA-Seq数据的质量，通常会检查______、______和______等指标。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述利用BLAST进行基因功能注释的基本步骤。

2.解释什么是GO富集分析，并说明其在一项研究中可能发挥的作用。

3.描述RNA-Seq数据分析的主要流程，包括关键的步骤和目标。

4.什么是转录因子（TF）？简述利用生物信息学方法预测TF结合位点的基本思路。

四、论述题（每题10分，共30分）

1.假设你获得了一组来自某种生物在不同处理条件下（如正常vs处理）的RNA-Seq数据。请设计一个基本的分析方案，阐述你会如何利用生物信息学方法来探究该处理条件对基因表达的影响，并初步解析可能涉及的生物学通路或过程。请说明主要的分析步骤、可能使用的工具或数据库，以及如何解读分析结果。

2.阐述生物信息学在功能基因组学研究中的核心价值。结合具体实例，说明生物信息学方法如何帮助我们理解基因的功能、调控网络以及它们在生命活动