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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学对细胞分化机制的揭示
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.下列哪项不是细胞分化过程中常见的表观遗传调控机制?
A.DNA甲基化
B.组蛋白修饰
C.非编码RNA的调控
D.基因重排
2.在研究细胞分化过程中基因表达变化时,RNA-Seq技术最核心的优势在于?
A.能够直接检测蛋白质表达水平
B.能够提供基因序列的详细信息
C.能够精确量化不同样品中数千个基因的转录本丰度
D.能够直接绘制细胞分化路径图
3.对于已知的特定转录因子(TF)结合位点富集区域(如ChIP-Seq数据),生物信息学分析方法中,哪个步骤主要目的是识别其下游潜在的调控目标基因?
A.序列比对
B.基因本体论(GO)富集分析
C.顺式作用元件搜索(CisTarget或similarRNA等工具)
D.差异表达基因筛选
4.在构建细胞分化调控网络时,以下哪种生物信息学工具或方法通常不直接用于展示节点间的相互作用强度或类型?
A.Cytoscape软件
B.KEGG通路数据库
C.交互作用预测算法(如STRING)
D.t-SNE降维可视化
5.测量细胞分化过程中蛋白质表达变化,以下哪种组学技术相对于转录组学,通常更能直接反映蛋白质的功能状态?
A.RNA-Seq
B.蛋白质组学(通过质谱MS)
C.ATAC-Seq
D.代谢组学
6.下列哪个数据库最常用于存储和检索基因序列、基因注释信息以及宏基因组学研究数据?
A.GO(GeneOntology)
B.PDB(ProteinDataBank)
C.NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation)
D.UniProt
7.在生物信息学分析中,对非编码RNA(ncRNA)进行功能注释时,以下哪种资源可能提供较为全面的注释信息?
A.BLAST
B.NCBIRefSeq
C.ENsemblNon-codingRNAs
D.UCSCGenomeBrowser
8.当你获得一组在不同细胞分化状态下差异表达的基因列表时,以下哪个分析步骤是理解这些基因可能参与的生物学过程或通路的关键第一步?
A.对基因列表进行排序
B.进行GO富集分析或KEGG通路分析
C.使用生物信息学工具进行序列比对
D.将基因列表导出到电子表格软件
9.单细胞RNA测序(scRNA-Seq)技术相比BulkRNA-Seq,其最突出的优势在于?
A.更高的测序深度
B.能够检测到更多的基因种类
C.能够揭示细胞群体内部的异质性和细胞间异质性
D.更低的成本
10.在生物信息学分析流程中,数据标准化(或归一化)的主要目的是?
A.提高测序通量
B.消除不同样品间技术噪音或批次效应的影响,使数据可比
C.简化后续的统计分析过程
D.减少测序错误率
二、填空题(每空1分,共15分)
1.细胞分化是指多能细胞逐渐转变为具有______和______的特化细胞的过程。
2.转录组测序(RNA-Seq)技术能够提供关于细胞内______丰度和______的动态信息。
3.ChIP-Seq技术通过结合固相测序,主要用于检测与______结合的DNA区域,从而揭示______调控。
4.生物信息学中的差异表达分析旨在识别在不同条件下______的基因。
5.基因本体论(GO)富集分析有助于我们理解一组差异表达基因在______、______和______方面的富集情况。
6.KEGG数据库提供了一个整合了基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据的______和通路分析平台。
7.在生物信息学分析中,常用的统计方法包括t检验、ANOVA以及更复杂的______和______等。
8.系统生物学网络构建的目标是整合多维度数据,揭示生物系统中______之间的相互作用和调控关系。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述利用RNA-Seq数据分析细胞分化过程中差异表达基因的基本流程。
2.简要说明表观遗传学数据(如DNA甲基化或组蛋白修饰数据)在揭示细胞分化机制中的作用。
3.解释什么
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