2025年单碱基分辨率甲基化（oxBS-seq）数据分析考核试卷.docVIP

2025年单碱基分辨率甲基化（oxBS-seq）数据分析考核试卷

一、单项选择题（每题1分，共30题）

1.oxBS-seq技术主要用于检测哪种DNA修饰？

A.甲基化

B.乙酰化

C.磷酸化

D.硫酸化

2.在oxBS-seq数据分析中，哪个软件用于进行质量控制和过滤？

A.Samtools

B.Cutadapt

C.FastQC

D.Bowtie

3.oxBS-seq数据中，峰值的定义是什么？

A.DNA序列中的C-G富集区域

B.读取深度最高的区域

C.甲基化位点

D.基因表达量

4.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行比对？

A.Bowtie

B.BWA

C.HISAT2

D.STAR

5.oxBS-seq数据中，如何识别甲基化位点？

A.通过测序深度判断

B.通过峰识别

C.通过覆盖度判断

D.通过软件自动识别

6.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行峰识别？

A.MACS2

B.PeakCall

C.HOMER

D.SICER

7.oxBS-seq数据中，如何进行背景校正？

A.使用未甲基化的对照样本

B.使用随机序列

C.使用软件自动校正

D.使用已知甲基化位点

8.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行差异甲基化分析？

A.DMC

B.MethylKit

C.MethylCov

D.MethylDackel

9.oxBS-seq数据中，如何进行甲基化水平计算？

A.通过读取深度计算

B.通过峰面积计算

C.通过覆盖度计算

D.通过软件自动计算

10.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行基因组浏览器可视化？

A.IGV

B.UCSC

C.Ensembl

D.GBrowse

11.oxBS-seq数据中，如何进行染色质结构分析？

A.通过ChIP-seq数据

B.通过ATAC-seq数据

C.通过RNA-seq数据

D.通过CAGE数据

12.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行关联分析？

A.GSEA

B.IngenuityPathwayAnalysis

C.KOBAS

D.DAVID

13.oxBS-seq数据中，如何进行时间序列分析？

A.通过多个时间点的样本

B.通过基因表达量

C.通过甲基化水平

D.通过染色质结构

14.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行富集分析？

A.GOseq

B.GSEA

C.DAVID

D.KOBAS

15.oxBS-seq数据中，如何进行通路分析？

A.通过KEGG数据库

B.通过GO数据库

C.通过Reactome数据库

D.通过WikiPathways数据库

16.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行样本聚类？

A.PCA

B.t-SNE

C.hierarchicalclustering

D.K-means

17.oxBS-seq数据中，如何进行分类分析？

A.通过机器学习算法

B.通过统计分析

C.通过生物信息学工具

D.通过实验验证

18.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行网络分析？

A.Cytoscape

B.Gephi

C.Pajek

D.igraph

19.oxBS-seq数据中，如何进行表观遗传调控分析？

A.通过ChIP-seq数据

B.通过ATAC-seq数据

C.通过RNA-seq数据

D.通过CAGE数据

20.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行甲基化图谱构建？

A.BisulfiteSeeker

B.MethylKit

C.MethylCov

D.MethylDackel

21.oxBS-seq数据中，如何进行甲基化动力学分析？

A.通过时间序列样本

B.通过基因表达量

C.通过甲基化水平

D.通过染色质结构

22.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行甲基化模式识别？

A.BisulfiteSeeker

B.MethylKit

C.MethylCov

D.MethylDackel

23.oxBS-seq数据中，如何进行甲基化变异分析？

A.通过SNP分析

B.通过基因表达量

C.通过甲基化水平

D.通过染色质结构

24.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行甲基化预测？

A.MethylPred

B.MethylKit

C.MethylCov

D.MethylDackel

25.oxBS-seq数据中，如何进行甲基化关联分析？

A.通过GWAS分析

B.通过基因表达量

C.通过甲基化水平

D.通过染色质结构

26.在oxBS-seq数据分析中，哪个工具用于进行甲基化时空分析？

A.STAMP

B.MethylKit

C.MethylCov

D.MethylDackel

27.oxBS-seq数据中，如何进行甲基化调控网络构建？

A.通过ChI