群体结构与交配系统.pptxVIP

群体遗传学;本章主要内容;§1.1遗传学基本概念和理论;基因的定义;基因的定义;基因座位;等位基因;一个二倍体生物个体组织细胞中的两对常染色体;纯合型、杂合型、复等位基因;基因型;基因（基因型）到性状（表型）;基因的显隐性;性状的显隐性;基因与环境共同决定表型;孟德尔豌豆单交杂交试验结果;遗传学分离定律;籽粒形状（圆粒对皱粒）和种皮颜色（绿皮对黄皮）两个性状的杂交试验;遗传学自由组合定律;一对同源染色体上，双杂合基因型AB/ab产生配子过程的示意图;遗传学连锁和交换定律;重组率r的作用;§1.2群体的遗传结构;基因频率和基因型频率;等位基因频率的估计;基因型频率的估计;基因频率和基因型频率的关系;群体的杂合度;单个座位上的杂合度;多个座位的平均杂合度;基因的多样性;基因的多样性;杂合度与多样性的关系;双亲群体中基因型的

期望分离比及其检验;一个294个RIL家系组成的玉米群体中，第9染色体上部分标记的1:1分离比适合性检验;一个F2玉米群体中，第9染色体上部分标记的1:2:1分离比适合性检验;§1.3自交和回交对群体结构的影响;交配系统及其分类;有性生殖及其分类;交配制度与群体结构和育种的关系;异交与群体结构和育种的关系;自交与群体结构和育种的关系;其它交配系统;自交对群体结构的影响;一个座位上、两个等位基因自F1代的自交分离示意图;

;重复自交过程中，一对和多对独立遗传基因座位纯合基因型的百分数;回交、供体亲本、轮回亲本;回交群体的表示和分类;回交对群体结构的影响;回交系统中基因型频率的变化;51;无选择情况下，排除不良等位基因b连锁于优良等位基因A的概率;锈病持久抗性研究:RaviSingh;§1.4随机交配与随机交配群体;随机交配的定义;两个群体间的随机交配;Hardy-Weinberg平衡(HWE)群体;HWE群体的随机交配后代仍然处于HWE状态;不管群体的起始频率如何,只要经过一代随机交配,群体就达到平衡;Hardy-Weinberg平衡定律;在一个平衡群体中，杂合子的频率不会超过0.5，也不可能大于纯合子的频率之和

H在p=0.5处达到极大值0.5;当一个等位基因的频率是另一个的2倍以上时，杂合体频率介于两种纯合体之间

D=H:p2=2pq,p=2q=2-2p,因此p=2/3,q=1/3;当一个a基因有很小的频率(q)时，该基因大多存在于杂合体中

杂合型Aa与隐性纯合型aa携带有害基因a的比例为

因此,对于很小的q,p/q会非常大;Hardy-Weinberg平衡定律的作用1;Hardy-Weinberg平衡定律的作用2;Hardy-Weinberg平衡定律的作用2;基因型随机交配与配子型随机交配等价;Hardy-Weinberg平衡定律的重要性;Hardy-Weinberg平衡定律的检验;样本容量为747的冰岛人的血型数据

WewanttotestifthepopulationinHWequilibrium:If(M,N)=(p,q),then(MM,MN,NN)=(p2,2pq,q2);F1自交与F1随机交配是等价的,因此F2是一个HWE群体;之后的自交世代（如F3、F4等）不是HWE群体;复等位基因的HWE;复等位基因的HWE检验;AnexampleonABObloodtypewhenwedon’thavetheexpectedfrequencies;性连锁基因

（XX为女性，XY为男性，Y染色体十分保守）;§1.5连锁对群体结构的影响;F2群体中两个连锁座位上基因型的种类;配子型和单倍型;F1产生四种配子的频率和连锁不平衡度;随机交配群体的配子别不平衡;连锁不平衡的度量(D);单倍体观测频率的另种表示;84;F2群体中的连锁不平衡度

（AABB×aabb）F1：AB/ab;连锁不平衡的其它度量方法;连锁不平衡的其它度量方法;不同度量方法的异同;多代随机交配过程中的连锁不平衡;90;TwolociAandBinfruitfly,17.8kbapartononechromosome;多代随机交配后的连锁不平衡度;多代随机交配后的累积重组率;随机交配多代的累积遗传图距;群体结构对LD的影响;群体结构对LD的影响;如果两个优良基因连锁在一起，我们希望连锁越紧密越好，两个基因能一起传递到下一代，这种连锁最好不要被打破。

如果一个优良基因和一个不利基因连锁在一起，则我们希望能打破这种连锁。;Breedingisatediousandlongprocedurewhenconsideringthenatureofcomplexinheritance:li