计划项目建议书（孟德尔遗传病相关基因变异解读规范和数据库建立的技术指南）.docxVIP

推荐性医疗器械行业标准计划项目建议书

项目称

（中文）

孟德尔遗传病相关基因变异解读规范和数据库建立的技术指南

项目称

（英文）

TechnicalGuidelinesforInterpretationStandardsofMendelianDisease-RelatedGeneticVariantsandDatabaseEstablishment

起草单位

山东大学

技委会或归口单位国内代号及称

SMD/TU007医用高通量

测序标准化技术归口单位

制定或修

订

制定

被修订标准编号

/

拟采用国际标准?称（中

文）

/

拟采用国际标准?称（英

文）

/

国际标准

号

/

ICS分类号

ICS11.100

标准类别

（注1）

管理标准

一致性程度标识

/

计划起始

时间

2026年1月

计划完成时间

2026年12月

目的、意义

我国是人口大国，也是遗传性疾病高发的国家，根据卫生部发布的《中国出生缺陷防治报告》显示，我国出生缺陷发生率约为5.6%，每年新增出生缺陷90-100万人，严重威胁我国人口健康。近年来分子测序技术快速发展，一系列新方法、新技术、新产品在遗传病诊治、辅助生殖技术、产前筛查诊断中得以推广和应用，高通量测序技术成为了遗传病诊断和出生缺陷防控的有力武器。随着高通量测序成本的下降，遗传病患者样本中所检测基因数目快速增加,测序数据大量产出，越来越多的变异被快速检出，如何快速准确的判断这些变异与疾病表型的关系，给变异分析和解读带了新的挑战。发现和正确解读疾病相关基因变异是遗传病分子诊断的关键，是临床干预的重要参考依据。目前行业内主要是通过致病性分级来对某个基因变异进行解读，根据不同的证据类型，将变异分为致病性变异、可能致病性变异、临床意义不明变异、可能良性变异及良性变异。通常，致病性变异和可能致病性变异被认为是有临床干预价值的变异，而可能良性变异和良性变异通常被认为不需要额外的干预。变异的分级直接影

响着临床的决策，甚至在产前诊断中可能决定了一个生命的去留，因此，

变异解读具有十分重要的临床意义。然而，目前由于缺乏统一的分类标准和对变异分类操作细节上的指导，导致同一个变异在不同实验室的分类结果大相径庭。近几年国家卫健委临检中心发布的遗传病室间质评报告指出，不同实验室的变异解读能力仍存在较大差异，同一变异位点普遍存在致病性分类结果不一致的情况，且部分实验室的分类解读SOP不具有可操作性或者变异解读流程不完善，标准不清晰等问题。这一现状给临床医生的遗传咨询带了很大的挑战，也给患者临床干预的决策带来了巨大的风险。本提案标准拟通过明确定义或阈值模糊的证据项内容、适当的证据项的权重、明确评级体系中个证据项的具体分值、明确各个证据项之间共用关系等评价标准和操作细节，同时结合我国实际情况，明确数据库的安全性、稳定性要求和数据质量要求，确保遗传变异解读的准确性和可靠性。推动我国遗传变异解读和数据库管理的标准化、规范化，对临床遗传

咨询和遗传病防治具有重要意义。

范围和主要技术内容

适用范围：本文件适用于对已检出的遗传病基因单核苷酸变异和短片段的插入/缺失变异致病性的判断。本文件不适用于复杂疾病相关基因变异，体细胞变异和线粒体DNA变异，及融合、拷贝数变异（除了限制在单一基因内的缺失）或其他染色体重排。主要技术内容：本文件提供了孟德尔遗传病相关基因变异的解读规范和数据库建立的技术指南，内容包括遗传病变异致病性评级的规则和评分标准、公共数据库或自建数据库的使用、评估及管理。具体包括：遗传病变异的注释要求、遗传病变异的致病性解读要求（包括证据等级、证据类型、证据加权规则、变异致病性分类）、数据库搭建的宏观要求、公共专家知识库和软件要求、变异评价结

果的数据构成要求、数据库的数据管理、质量评价、评价数据集等。

主要强制的内容和强制的理

由

/

与有关法律、法规和强制性标准的关

系

本标准与有关的现行法律、法规和强制性国家标准不冲突。

标准所涉及的产品

清单

/

国内外有关情况及发展趋势

1、国内外遗传变异解读的标准、指南、共识现状目前国内外尚无相关国家和行业标准。国内目前已开展《瘤体细胞变异解读规范和数据库建立的技术指南》的制定工作，但并无孟德尔遗传病相关基因变异解读规范和数据库建立的相关技术标准。尽管国际上已有部分指南、共识，但存在诸多问题：2015年美国医学遗传学与基因组学学会/分子病理学协会

（AmericanCollegeofMedicalGeneticsandGenomics/AssociationforMolecularPathology，ACMG/AMP）联合发表了遗传变异的分类标准与指南，包含16条致病证据项，12条良性证据项