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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种变异类型属于单核苷酸多态性(SNP)?
A.长度为3bp的插入
B.单个碱基的替换(A→T)
C.染色体倒位(100kb)
D.三核苷酸重复扩增(如CAG重复)
答案:B
解析:SNP定义为单碱基的替换或颠换(A→T/C/G),长度严格为1bp。A为小插入(Indel),C为结构变异(SV),D为短串联重复(STR)变异,均不符合SNP的定义。
基因数据质量控制中,常用的测序深度评估指标是?
A.等位基因频率(MAF)
B.平均测序深度(MeanDepth)
C.连锁不平衡系数(r2)
D.杂合子比例(HetRate)
答案:B
解析:平均测序深度(MeanDepth)直接反映测序数据的覆盖度,是质量控制的核心指标。MAF是群体遗传学指标(描述变异频率),r2衡量标记间连锁程度,HetRate反映样本杂合变异比例,均非测序深度评估指标。
以下哪个数据库主要用于存储临床致病性变异信息?
A.gnomAD(基因组聚集数据库)
B.ClinVar(临床变异数据库)
C.dbSNP(单核苷酸多态性数据库)
D.1000Genomes(千人基因组计划)
答案:B
解析:ClinVar由NCBI维护,专注于收集与疾病相关的变异及其临床意义(如“致病”“意义未明”)。gnomAD和1000Genomes侧重群体变异频率,dbSNP主要记录变异位置信息,不涉及致病性。
对编码区错义突变进行功能预测时,常用工具不包括?
A.SIFT(序列同源性预测)
B.PolyPhen-2(结构预测)
C.dbNSFP(综合功能注释)
D.GATK(基因组分析工具包)
答案:D
解析:GATK是变异检测与数据处理工具(如碱基校正、变异调用),不直接用于功能预测。SIFT、PolyPhen-2、dbNSFP均为功能预测工具(分别基于序列保守性、蛋白质结构、多工具整合)。
连锁不平衡(LD)主要用于描述?
A.同一基因内不同外显子的表达相关性
B.染色体上两个标记(如SNP)的共遗传频率
C.测序数据中重复序列的比对误差
D.肿瘤样本中体细胞变异的克隆性
答案:B
解析:LD指染色体上两个遗传标记(如SNP)由于物理距离近,在群体中倾向于共同遗传的现象(常用r2或D’衡量)。其他选项均与LD的定义无关。
评估变异的群体频率时,若某变异在东亚人群中的MAF为0.001,提示?
A.该变异可能为致病突变(低频/罕见)
B.该变异必然为良性(高频)
C.需结合其他证据(如功能影响)综合判断
D.该变异在所有人群中的频率均相同
答案:C
解析:MAF仅反映变异在群体中的常见程度,低频变异(如MAF0.01)可能为致病突变,但需结合功能影响(如错义/无义)、家系共分离、文献报道等综合判断。A错误(可能但不必然),B错误(低频≠致病),D错误(不同人群频率可能差异大)。
以下哪种结构变异(SV)检测技术灵敏度最高?
A.短读长测序(Illumina)
B.长读长测序(PacBio/Nanopore)
C.芯片技术(aCGH)
D.PCR扩增
答案:B
解析:长读长测序(10kb)可直接跨越重复区域和大插入/缺失,对SV(如倒位、易位)的检测灵敏度显著高于短读长(仅能检测小SV)、芯片(分辨率低)或PCR(依赖已知引物)。
基因数据解读中,“知情同意”的核心伦理要求是?
A.确保受检者理解检测目的、风险及结果的局限性
B.仅向医生披露检测结果,保护隐私
C.强制要求受检者接受所有检测项目
D.无需告知检测结果的潜在心理影响
答案:A
解析:知情同意要求受检者在充分理解检测内容(如用途、可能的结果类型、隐私保护措施)后自愿参与。B错误(需向受检者本人披露),C错误(强制违反自愿原则),D错误(需告知潜在风险)。
RNA-seq数据解读中,“FPKM”指标主要用于?
A.评估测序数据的比对质量
B.量化基因的表达水平
C.检测可变剪切事件
D.分析差异表达基因的功能富集
答案:B
解析:FPKM(每百万映射reads的外显子每千碱基片段数)是标准化的基因表达量计算方法,用于衡量基因转录本的丰度。A对应比对率(如Q30),C对应外显子跳跃分析,D对应GO/KEGG富集分析。
生信分析流程验证时,“金标准数据集”的作用是?
A.降低测序成本
B.验证流程的准确性(如变异检测灵敏度/特异度)
C.减少生信分析时间
D.替代临床验证
答案:B
解析:金标准数据集(如NIST参考材料)包含已知的真实变异,用于评估生信流程的性能(如正确检测率、假阳性率)。A、C与流程验证无关,D错误(临床验证需结合医学证据)。
二、多项选
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