02李金明-高通量测序技术临床应用质量管理6.17.pdf

高通量测序技术临床应用

质量管理

李金明国家卫生计生委临床检验中心

基因测序技术的发展

l1953年：DNA双股螺旋的发现（英国剑桥大学JamesWatson和FrancisCrick）

l1965年：酵母tRNA测序（美国Comell大学RoberHolley，小片段重叠法）

l1971年：λ噬菌体两个粘性末端的完整序列（吴瑞博士，华裔分子生物学专家，

引物延伸测序）

l1975年：加减法DNA测序（英国剑桥大学Fred）

l1977年：Sanger测序（英国剑桥大学FredSanger）和Maxam-GillbertDNA化学

降解法测序(美国哈佛AlanMaxamWalterGilbert）

l1996年：焦磷酸测序（瑞典皇家技术研究所RonaghiM等）

l2005年:GenomeSequencer20新一代测序仪(大规模并行焦磷酸合成测序法，454

lifeScience公司的创始人JonathanRothberg)

l2007年:454、Solexa公司和Agencourt（SoliD测序仪）公司分别被

Roche、illumina和ABI公司收购。新一代测序技术（next-generation

sequencing）2007年被NatureMethods评为生物领域影响力最大的技术

精准医学不等于高通量测序

高通量测序是精准医学的支点

高通量测序技术的临床应用

l染色体非整倍体无创产前筛查（NIPT）

l胚胎植入前遗传学筛查（PreimplantationGeneticScreening，

PGS）和胚胎植入前基因诊断（PreimplantationGenetic

Dignosis，PGD）

l肿瘤靶向治疗基因突变检测

l单基因遗传病检测

l病原微生物检测：如HPV基因分型、宏基因组

（Metagenomics）测序

l┈┈

高通量测序技术临床应用的规范化和质量管理

l国家卫生计生委医政医管局高通量测序临床应

用试点实验室：评审标准、评审、试点实验室

基本要求、管理试点实验室

l2015年增加质评调查：全国肿瘤诊断与治疗高

通量测序检测

l2016年新增质评计划：染色体非整倍体（21、

13、18）无创产筛

l2016年即将增加质评调查：肿瘤游离DNA

（ctDNA）检测

批准的第一批四个专业的试点单位

国家卫生计生委高通量测序试点

实验室要求

基本要求（1）

l1.试点实验室应在国家卫生计生委批准的试点专

业范围内开展临床检测工作。

l2.试点实验室需采用高通量测序开展不少于一项

的检测项目。

l3.为避免污染所致的假阳性结果，各试点实验室

应根据所开展的检测项目进行分区，具体各专业

实验室的分区要求由国家卫生计生委临床检验中

心负责发布。

产前筛查与产前诊断（全基因组低拷贝测序技术）

测序区文库扩增标本与文试剂准备区

与检测区库制备区

空气流向空气流向空气流向空气流向

缓冲间缓冲间缓冲间缓冲间

专用走廊工作流向

标本与文库制备区

文库扩增与检测区

测序区

植入前胚胎遗传学诊断(全基因组低拷贝测序)

电泳区测序区文库检测区扩增一区WGA制备区试剂准备区

空气流空气流向空气流向空气流向