水稻的病程相关基因_窦世娟.docVIP

2014 年  第 59 卷  第 3 期：245 ~ 258  《中国科学》杂志社 评 述   SCIENCE CHINA PRESS  水稻的病程相关基因 窦世娟?, 关明俐?, 李莉云, 刘国振* 河北农业大学生命科学学院, 保定 071001 ? 同等贡献 * 联系人, E-mail: gzhliu@ 2012-12-26 收稿, 2013-03-04 接受, 2013-10-17 网络版发表 国家自然科学基金资助  摘要  在几乎所有的植物中都有病程相关(pathogenesis-related, PR)基因的报道, 其广泛存在  关键词 及序列特征和功能的保守性提示着其重要性. 最初发现 PR 基因主要是由于它们在植物受到病 原物侵染时会大量表达. 但近年来的研究表明, PR 基因在衰老、伤害、非生物逆境胁迫、激 素处理甚至正常生长发育过程中也发挥着作用. 由于 PR 基因种类、数目较多, 前期的命名系 统不统一, 给深入了解 PR 基因的功能造成了不便. 本文系统整理了水稻 PR 基因的相关报道, 集合了 PR 基因的类别、数目、名称、注释信息、代表性基因的功能, 归纳了 PR 基因在抗 病、抗逆和发育过程中的转录或表达特征及转 PR 基因后的表现, 并以 Loc 号和序列为核心, 将文献中有不同名称的同一基因进行了对应. 另外, 还展望了水稻 PR 基因研究的意义和今后 的重点研究方向, 以供同行参考. 水稻 病程相关基因 抗病 逆境胁迫 发育  病 程 相 关 (pathogenesis-related, PR) 蛋 白 质 是 植 物受病原物胁迫后诱导产生并积累的一类蛋白质的 总称, 是植物防卫体系的重要组成部分. 它们往往在 植物抗病反应的下游发挥作用 , 在很多情况下是直 接限制病原物生长的主要因素. 在不同的物种中, 都  能. 本文以 Loc 号和序列为核心对水稻 PR 基因的相 关报道进行了归纳整理. 在此基础上, 推荐了一组在 抗 病 、 抗 逆 研 究 中 应 用 较 为 广 泛 的 PR 标 志 物 , 并展望了水稻 PR 基因研究的意义和今后的重点研究 方向. 存在着数据众多的 PR 基因, 这一事实说明这类基因 在植物的进化过程中发挥着重要的作用 . 所以了解  1  水稻 PR1 基因家族 PR 的功能是植物抗病机理研究的重要组成部分, 也 对调控植物的抗病性具有现实意义. 根据 PR 基因编 码蛋白质的氨基酸序列相似性、血清学关系和酶分子 的活性最早将 PR 分为 17 个家族, 同一家族内的 PR [1] 作物之一, 也是单子叶植物研究的模式生物, PR 基 因的表达及其功能是水稻研究的重要内容. 由于 PR 基因数量较大且命名系统不统一 , 使不同实验室间 的数据难以比较和参照 . 水稻全基因组测序工作的 完成及系统注释为全面了解水稻的 PR 基因提供了可 OsPR1a 和 OsPR1b 是最早报道的水稻 PR1 基因 家族成员 [2~4], 其编码的蛋白质属于类丝氨酸羧肽酶 (serine carboxypeptidase-like proteins, SCPLs). 在水 稻基因组中有 40 个注释为 SCPL 的基因(表 1, 表 S1), 目前报道的水稻 PR1 都属于这一类. 另外, 在水稻基 因 组 中 , 还 有 59 个 编 码 丝 氨 酸 羧 肽 酶 (serine carboxypeptidase, SCP)的基因, 一并列入 PR1 家族中, 但后者目前还没有功能或表达相关的报道(表 S1). PR1 基因经常被作为抗病反应发生的分子标记[64]. OsPR1a 和 OsPR1b 基因受稻瘟病菌(Magnepor the  引用格式: 窦世娟, 关明俐, 李莉云, 等. 水稻的病程相关基因. 科学通报, 2014, 59: 245–258 Dou S J, Guan M L, Li L Y, et al. Pathogenesis-related genes in rice (in Chinese). Chin Sci Bull (Chin Ver), 2014, 59: 245–258, doi: 10.1360/ 972012-1831 2014 年 1 月  第 59 卷  第 3 期 表 1 水稻中已知的 PR 家族成员  PR 家族  报道的 PR 基因  Loc 号  注释 被报道家族 成员数目 参考 文献 PR1 14  PR2 PR3 PR4 OsPR1#011; PR-1b OsPR1#012; PR-1c OsPR1#021 OsPR1#022 Os