973项目申报书——重要热带作物木薯品种改良基础研究.docVIP

项目名称： 重要热带作物木薯品种改良的基础研究 彭明 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 2010年1月-2014年8月 农业部 海南省科技厅 1、木薯淀粉高效累积的采用淀粉品系，监测块根发育全过程，cDNA文库miRNA测序及其靶基因预测分析，（Target genes）综合和表达谱高淀粉、野生种糖木薯3个基因组这些功能基因在进化中的结构演化比较基因组学木薯近缘作物光合产物形成与分配的共性机制 2、木薯逆境适应的调控机理 选择对干旱、土壤贫瘠耐性和敏感的木薯基因型，完成诱导和非诱导胁迫处理的生物学过程，测定个处理的转录组和miRNA表达信息mRNA基因的表达类型及其丰度信息木薯逆境诱导表达的miRNA，并根据miRNA基因序列，预测miRNA调控的靶基因（Target genes）。进行差异表达分析和miRNA与靶基因相互作用分析。将关键抗逆基因定位到物理图谱，利用拟南芥等的转基因方法对其中若干重要基因进行功能验证，为木薯抗逆遗传改良提供新的基因资源。比较基因组学木薯近缘作物抗旱耐贫瘠的关键基因。 3、木薯重要基因的功能验证与分析 建立在相对成熟的木薯遗传转化体系基础上，采用基因敲除和过表达策略，将光合产物高效累积及逆境适应关键基因入木薯进一步阐明关键代谢途径同时具有不同淀粉品质的木薯新种质4、木薯分子育种技术集成与种质创新 核心利用全基因组序列和关键代谢途径表达基因（EST）开发大量SNP、EST-SSR标记，构建高密度分子遗传图谱，整合物理图谱，定位重要经济、抗逆性状的QTL，实用的分子标记辅助育种技术；发展细胞原生质体融合杂交传统杂交育种，建立亲本杂交分子田间选择的现代育种技术体系，快速、高效培育木薯新品系。 1、总体目标 通过项目的实施，以木薯为热带作物典型材料，探索其淀粉高效累积和抗逆的分子遗传基础，解析木薯光合产物高效积累的基因调控模式，揭示其淀粉持续高效累积的生物学基础和逆境适应的分子机制，旨在解决热带作物光合产物高效累积的关键性基础理论问题；发掘具有应用价值的基因资源和分子标记，发展新的分子育种综合技术，为木薯新品种培育奠定坚实的应用理论基础。建设一支高水平的研究团队，推动木薯及热带作物产业的可持续发展。2、五年预期目标阐明木薯淀粉高效累积的主要代谢途径，及抗旱、耐贫瘠等逆境的分子机理发掘关键基因、新的miRNAs及其靶基因，构建多层次的表达调控网络； 验证光合产物高效累积及抗旱、耐贫瘠6-10个重要基因的功能； 阐述木薯及近缘作物光合产物积累和抗逆的共性机制； 整合木薯物理图谱与遗传图谱，并开发2000个以上木薯SNP 和SSR标记； 建立分子育种与传统育种相结合的育种体系，培育出高产抗逆的木薯新种质或新品系-10个； 发表高质量学术论文30-40篇，累计影响因子100点以上； 培养硕士、博士研究生50-60名； 建立多学科交叉的木薯研究创新团队。 向基因发掘的综合技术手段，重点解决木薯淀粉高效累积机制和逆境适应的调节机制2个核心问题，然后对主要代谢途径中的关键基因进行功能验证和分析，发掘基因资源和分子标记，建立整合分子育种技术，形成热带作物光合产物高效累积与抗逆的理论基础和技术储备。 木薯淀粉高效累积与抗逆的分子机制及应用的总体研究方案 取得重大突破的可行性 （1）木薯基因组测序成为重要基础 中国热带农业科学院组织正在进行的木薯全基因组测序计划，将于2009年底前全部完成。其成果不仅首次提供了木薯全基因组序列，指导有关光合产物累积代谢途径和抗逆途径的基因簇结构域定位，而且通过对3个基因型序列草图的比较显示这些代谢途径基因序列的进化关系。同时在大量开发SNP标记、转录组分析的表达基因定位、miRNA发现及其靶基因预测等均具有奠基作用整个计划围绕2个关键科学问题，采用了一套固定的材料在木薯淀粉累积代谢途径研究中，采用率差异极大的品种Arg7淀粉率32%和野生近缘种W14淀粉率5%个基因型，其中Arg7为2004年引自阿根廷近缘野生种W14来自巴西野生自然种群，是木薯栽培种的祖先拥有多样化的基因类型差异显著的品种（华南124 与Ku50耐旱耐贫瘠，Arg7对干旱和土壤贫瘠敏感），华南124Ku50是泰国选育的东南亚推广面积最大的品种，兼具高产、高淀粉特性野生近缘种CAS36（巴西木薯突变体，块根还原糖含量在15-20%乙醇转化率通过对3个品种基因组草图序列比较，揭示木薯基因组中与淀粉累积代谢相关的基因结构域及其进化关系在基因功能验证环节，除了木薯遗传转化体系可以将部分关键基因进行转基因敲除或者过表达验证其功能，一些T-DNA插入突变体，低温敏感突变体（ASP1-13），糯性突变体（A37）和无块根突变体（A08）。是发现科学规律，揭示基因调控奥秘的设计基础。实验将采用超高通量