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复杂疾病研究简介 徐煜 xuyu@genomics.org.cn 2011年5月12日  复杂疾病研究概述  复杂疾病的特征  复杂疾病的研究方法  基因与复杂疾病的关系——关联分析  关联分析概述  两个简单的模型  关联分析的特点及方案设计  一些其他的重要概念  复杂疾病研究现状 遗传因素 环境因素 复杂疾病 冠心病 唐氏综合症 车祸 中风，脑血管疾病 色盲 癌症 复杂疾病的特征  受遗传因素和环境因素双重影响，发病机制复杂  临床表现复杂，表征困难 常见疾病常见变异(CD-CV)假设 Manolio T. A. et al (2009) Nature 461, 747-753, adapt from McCarthy M. I. et al (2008) Nature Review Genetics 9, 356-369  常见的复杂疾病  遗传上的风险常由多个微效基因的影响累积形成  不同患者的遗传背景可能不同，存在遗传异质性  非常见（5/10,000)的复杂疾病  由多个低频高效的变异引起的复杂疾病 复杂疾病的研究方法  临床研究（诊断，治疗）  流行病学研究  病理学研究  病因学研究  环境因素  遗传因素：找到与疾病关联的基因 与疾病关联的基因的功能验证  通路分析  分子生物学验证  细胞生物学验证  动物模型验证 关联分析结果的临床应用 McCarthy M. I. et al (2008) Nature Review Genetics 9, 356-369 基因与复杂疾病的关系——关联分析  关联分析的基本思想  在基因与疾病没有关联的情况下，基因在种群中是随 机分布的  如果某个基因在患病人群中频率偏离了在整个种群中 随机抽样得到的频率，那么这个基因在患病人群中的 出现具有一定的倾向性  通过假设检验，找到/确认某个基因/位点在某一疾病 的患病人群中的出现具有倾向性，那么我们称该基因 与该疾病的发生相关 关联分析的分类及各自的特征  关注的区域  表型种类  特定基因/区段  0-1性状  外显子组  数量性状  全基因组  复杂性状  样品来源  基因分型方法  基于群体的研究  基于芯片的  基于家系的研究  基于测序的 两个简单的数学模型  Trio-based  Case-control