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第一个被发现的miRNA: lin-4 微小RNA的作用特点 主要是在蛋白质水平调控 5’端2-8个核苷酸高度保守,主要作用在靶mRNA的3’端非翻译区(unstranslated region, UTR) 分完全和不完全配对两种方式,哺乳动物主要为不完全配对结合,影响mRNA的成熟、转运、稳定性或者在直接调控翻译 是翻译抑制还是剪切mRNA,除配对因素外,还取决于RISC中组装元件的功能,如Arg蛋白 3. miRNAs与心血管疾病 * * 微小RNA及其在医学中的应用 一、微小RNA的发现 人类基因组中,蛋白质编码区只占1-2%。其它98%的基因组有什么功能呢?约24%为内含子序列,这么冗长的内含子序列有什么生物学功能呢? 后基因组时代的中心法则 RNA 加工 基因调节 DNA 修复和重组 基因组的保持 基因组的表达 后基因组时代的基因调控:RNA 调控 人类基因组绝大部分被转录成RNA 非编码RNA的数量是编码RNA的数百倍 生物体复杂性被隐藏在它们所输出的非编码RNA内,而非编码序列内。 2006年的诺贝尔生理学奖获得者: Andrew Z. Fire Craig C. Mello 第一个被发现的miRNA (lin-4)由哈佛大学的Victor Ambros 发现的(1993) 第二个被发现的miRNA(let-7)由哈佛大学的博士后Frank Slack (Ruvkun 实验室)发现的(2000) Victor Ambros Gary Ruvkun 微小RNA(microRNA, miRNA)的发现 Ruvkun G, Wightman B, Ha I. The 20 years it took to recognize the importance of tiny RNAs. Cell. 2004 Jan 23;116 (2 Suppl):S93-6. Lee R, Feinbaum R, Ambros V. A short history of a short RNA. Cell. 2004 Jan 23;116 (2 Suppl):S89-92 近年来被鉴定的miRNAs越来越多 至今超过17000 miRNAs已被发现 可以免费获得 http://microrna.sanger.ac.uk/sequences/ 二、微小RNA的特点 小干扰RNA(small interfering RNA; siRNA) 和微小RNA的异同点 在转录水平后和翻译水平起作用 作用方式 都是RISC组分,其功能界限变得不清晰,如二者在介导沉默机制上有重叠 蛋白RISC组分 需要Argonaute家族蛋白参与 Argonaute家族 是Dicer的产物 Dicer酶 由双链RNA或RNA前体形成的 合成的底物 22nt左右 长度 miRNA siRNA 相同点 siRNA和miRNA的相同点 不完全互补,存在错配现象 一般要求完全互补 互补性 对机体生长发育,神经分化,脂类代谢,细胞增殖分化,肿瘤发生有重要作用 抵抗病毒感染; 沉默过分表达的mRNA; 保护基因组免受转座子的破坏 生物学功能 相对较低 较高 对靶RNA特异性 单链RNA 双链RNA 分子结构 发夹miRNA前体 长链双链RNA 直接来源 生物体自身的正常调控机制 外源引起,如病毒感染诱导产生,异常情况 机制性质 miRNA siRNA 不同点 三、微小RNA的主要功能 miRNA 发育 增殖 (干细胞) 疾病 分化 凋亡 Victor R. Ambros 秀丽线虫 C. elegans 1. 调控发育过程 miR-124a局限表达于神经组织 miR-1局限表达于骨骼肌和心肌 青鳉 斑马鱼 小鼠 果蝇 miRNA的表达具有组织特异性 ( Science 2004) 3种miRNA控制造血干细胞向淋巴细胞的分化过程 2. 调控细胞分化 (调控心肌前体细胞的增殖) microRNA host or virus 禽流感病毒 Avian influenza virus 疱疹病毒家族 EBV,KSHV,MHV-68, HCMV,HSV-1 HBV,HCV 逆转录病毒家族 HIV-1 多瘤病毒家族 SV40(Simian virus 40) 腺病毒家族 hAV(adenovir) 4、miRNA 与病毒感染 miRNA与肝炎病毒 HCV HBV ≠ ≠ ≠ ≠ miRNA 基因表达 信号传导 肝细胞肝癌发生、发展 诊断、治疗 在肝炎模型中发现的肿瘤相关miRNA HCV HBV has-miR-191 Worse sur
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