云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因分子结构特征分析.pdfVIP

云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因分子结构特征分析.pdf

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云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因分子结构特征分析.pdf

2010,26 (2) 中 国 人 兽 共 患 病 学 报 ChineseJournalofZoonoses 101 文章编号 :1002—2694(2010)02—0101—06 云南边境禽流感 H5N1亚型病毒血凝素 基因分子结构特征分析* 叶丛华 ,张文 东。,宋建领。,范泉水 ,张应 国 ,张富强 摘 要 :目的 分析2003 2008年云南边境禽流感 H5N1亚型病毒血凝素 (HA)基 因分子结构特征 。方法 对 2003— 2008年在云南边境采集境外禽类样 品420份 ,做 H5/N1亚型特异性RTPCR及 多重 RTPCR检测 ,对 阳性样 品中H5N1病 毒 HA基 因进行 RT—PCR扩增 ,克 隆至pMD18-T载体测序 ,并与国内外 已知参考毒株序列进行 比对及系统发育分析 。结果 21份代表性病毒样 品HA裂解位点序列存在 4种不 同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征 ;HA受体结合 位 点、糖基化位点及表位关键性氨基酸位 点存在变异;系统发育分析表 明可划分为5个不 同进化分枝 (1、2.4、2.3.2、2.3.4、 7)。结论 2003 2008年云南边境外 H5N1病毒间具有遗传差异,进化分枝 2.3.4毒株为 当地流行的优势毒株 ,不 同进化分 枝或 同一进化分枝不 同毒株 HA基 因存在变异。 关键词 :禽流感病毒;H5N1亚型;血凝素 ;分子特征 ;进化分枝 中图分类号 :S8553 文献标识码 :A M olecularcharacteristicsofthehem agglutinin genesofavian influenzavirus subtypeH5N1in theboundaryregion ofYunnan province YEConghua,ZHANG W en—dong,SONG Jian—ling,FAN Quan—shui,ZHANG Ying—guo,ZHANG Fu—qiang (CentreforDiseaseControlandPrevention,ChengduMilitaryRegion,Kunming650032,China) ABSTRACT:Toelucidatethemolecularcharacteristicsofthehemagglutinin (HA)genesofH5N1subtypeofavianinfluen zavirusesintheboundaryregionofYunnanprovince.Of420sampleswerecollectedfrom theforeignpoultryinboundaryre gionofYunnanprovinceduring2003to2008andthesesamplesweresubjectedtoscreeningbyH5/N1subtype—specificand multiplexRT PCR.testing.TheHA genesofH 5N1virusesfrom positivesampleswereamplifiedbyRT PCR andcloned into vectorpMD18T forsubsequentsequencing.Thealignmentwith sequencesoftheknownreferencestrainsandphylogenetica— nalysiswerethenperformed.Thegenesfrom 21representativepositivesampleswith4differentsequencesatthecleavagesite wereobtainedandallofthem possessedthemolecularcharacteristicofhighlypathogenicavianinfluenzavirus.Themutationof keyaminoacidshadbeenfoundamongreceptor—bindingsites,potentialglycosylationsitesandneutralizingepitopes.Phyl

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