基因组重排技术应用及进展.pdfVIP

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１０，３０（７）：１０８１１１ ? 基因组重排技术应用及进展 １ ２ ２ １ 卢圣国　李　霜 　朱建国　孟庆雄 （１昆明理工大学生命与科学技术学院　昆明　６５０２１６　２南京工业大学国家生化工程研究中心　南京　２１１８１６） 摘要　基因组重排技术结合了传统诱变技术和细胞融合技术，是一项对整个微生物基因组重排 的新型育种技术。基因组重排技术通过多亲本原生质体递归融合，可以使工程菌快速获得多样 复杂优良表型，并且无须了解其基因组学、代谢组学等具体背景。介绍了基因组重排技术的过程 及应用，展现了基因组重排技术的优点，并给出了基因组重排技术的发展在未来的应用情景。 关键词　基因组重排　原生质体融合　微生物育种　细胞表型优化　代谢工程 中图分类号　Ｑ８１２ 　　进入２１世纪，面对石化资源和能源危机、环境危 交换、重组，经过多轮递归融合后促使正向突变表型聚 机日益加剧，以可再生生物质资源为原料的生物技术 集，与经典诱变育种，原生质体融合相比具有明显的优 产业展现出前所未有的竞争力，推动了工业菌株育种 势（表１）。 技术的发展。传统育种技术工程量巨大，耗时长，且难 表１　不同育种技术的比较 于获取复杂表型。近十几年里，工业菌株改造主要集 Ｔａｂｌｅ１　Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｂｒｅｅｄｉｎｇｓ 中在代谢工程。该技术主要是运用现代基因手段，对 Ｃａｔｅｇｏｒｙ ＯｂｊｅｃｔＩｎｉｔｉａｌ Ｓｔｒａｉｎ ［１］ Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ Ｅｎｔｉｒｅｇｅｎｏｍｅｓ Ｏｎｅｓｔｒａｉｎ 微生物进行定向基因操作 。虽然代谢工程育种较传 ＰｒｏｔｏｐｌａｓｔｆｕｓｉｏｎＥｎｔｉｒｅｇｅｎｏｍｅｓ Ｔｗｏｐａｒｅｎｔｓｐｅｒｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ 统育种取得了一定成果，但是基因型和表型相应背景 ＤＮＡｓｈｕｆｆｌｉｎｇ ＤＮＡＦｒａｇｍｅｎｔｓＭｕｌｔｉｐｌｅｐａｒｅｎｔｓａｔｅａｃｈｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ 的欠缺会限制其更广范围的利用。 ＧｅｎｏｍｅｓｈｕｆｆｌｉｎｇＥｎｔｉｒｅｇｅｎｏｍｅｓ Ｍｕｌｔｉｐｌｅｐａｒｅｎｔｓａｔｅａｃｈｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ 　　基因组重排技术是一种典型的全面组合技术手 　　首先，相较诱变育种、原生质体融合技术等，基因 段，是全基因组代谢工程的延伸。２００２年，Ｚｈａｎｇ等［２］ 组重排技术具有更高的效率。诱变育种具有盲目性、 在Ｎａｔｕｒｅ上发表文章，首次提出基因组重排技术——— 随机性，导致工程量巨大，时间漫长，菌株突变面临回 结合传统育种技术，通过多亲本之间的ＤＮＡ重组和全 复现象的难题。原生质体融合技术可以扮演类似于有 基因组片段交换，将优良表型重组在一起的过程。 性生殖途径基因信息交流的作用，但是有性生殖途径 Ｚｈａｎｇ等将基因组重排技术运用于改造弗氏链霉菌 只能允许在双亲本之间的基因重组。基因组重排技术 （Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓｆｒａｄｉａｅ），极大的提高了其合成泰乐菌素 基于多亲本之间的递归融合，具有更大基因突变来源； （ｔｙｌｏｓｉｎ）的能力。基因组重排技术具有菌株改造方面 递归融合还能使正向突变的表型聚集，多轮融合极大 的优异表现，被认为是菌株选育和代谢工程上的一个