Monte Carlo 方法在遗传育种应用.docVIP

Monte Carlo 方法在遗传育种中的应用 Monte Carlo 方法在遗传育种中有着十分广泛的应用，下面举出一些例子。 遗传漂变的模拟 遗传漂变是指在一个没有选择、迁移、实施随机交配的小群体中，群体基因频率和基因型频率会偏离Hardy-Weinbger平衡。利用Monte Carlo 方法，我们可以模拟随机遗传漂变的过程，研究各种因素，如群体大小、公母比例、繁殖力等，对遗传漂变的影响。具体做法如下： 设定系统参数 N – 基础群大小 S – 基础群公母比例 no – 每头母畜每胎所产后代数 P1、P2、P3 – 所考查的基因座位在基础群中的基因型频率（假设只有两个等位基因） g – 所考查的世代数 nr – 模拟重复次数 假定 公、母随机交配， 每头公畜与相同数目的母畜交配 后代为雄性和雌性的概率各为1/2， 基因从上代到下代的传递遵从孟德尔分离定律 世代不重叠 群体规模保持不变 每代中随机选留种畜 模拟试验 基础群中每个个体的性别和基因型的确定 设雄性个体的代码为1，雌性个体的代码为2。再设两个等位基因的代码分别为1和2，三种基因型的代码分别为11、12和22。 基础群中每个个体的性别和基因型可以硬性规定，也可以随机确定，如硬性规定，即人为指定哪些个体是雄性，哪些个体是雌性，哪些个体的基因型为11，哪些为12，哪些为22。但要注意必须符合事先给定的公母比例和基