临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹库的构建.pdfVIP

中国生物工程杂志 临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹库的构建 闫 慧 黄文芳 杨永长 肖代雯 姜伟 罗春丽 重庆医科大学医学检验系临床检验诊断学教育部重点实验室重庆 四川省医学科学院四川省人民医院成都 摘要 为建立临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库为快速鉴定这些细菌奠定基础收集了从 临床中分离获得的 株革兰氏阳性球菌 包括金黄色葡萄球菌 表皮葡萄球菌 溶血性葡萄球 菌粪肠球菌和屎肠球菌 将这些菌株分成建模组和验证组利用表面增强激光解析电离飞行时 间质谱检测细菌蛋白用 和 软件对建模组细菌数据进行分析筛选 出每种细菌各自稳定表达的蛋白峰并将数据导入自建的软件建立了临床常见革兰氏 阳性球菌的蛋白指纹库 随后 将验证组细菌的蛋白峰数据与蛋白指纹库中蛋白峰数据进行相 似度分析 以评价其鉴定符合率 建立了包含 种临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库 利用 其对验证组菌株进行鉴定 与应用传统微生物学鉴定及分子生物学方法获得的鉴定结果的符合 率为 结果表明 进一步扩大并完善革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库 将为临床病原菌的快 速鉴定提供可能 关键词革兰氏阳性球菌表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白指纹库 中图分类号 革兰氏阳性球菌是医院内感染和社区获得性感染 种真菌的蛋白表达建立了包含 种真菌及 种对照菌 的重要病原菌以金黄色葡萄球菌凝固酶阴性葡萄球 株的标准蛋白峰谱数据库并通过验证菌株与数据库 菌及肠球菌占据前三位其快速鉴定对抗感染治疗及 比较并计算其相关系数来鉴定细菌 基于这一设想 院内感染监控具有十分重要的意义 传统的依赖于细 本研究采用 技术检测细菌蛋白指纹图 菌形态学生理生化特征的鉴定方法存在耗时长特异 谱结合自行设计的软件建立临床常见革兰 性和敏感性不高等问题 虽然基因组学技术也已应 氏阳性球菌蛋白指纹库为细菌的快速鉴定奠定基础 用于微生物鉴定 但想通过基因序列研究海量的微 材料与方法 生物仍非易事 质谱蛋白组学技术近年来已成为一种 快速鉴定病原微生物的重要技术手段已有研究 报 材料 道利用表面增强激光解析离子飞行时间质谱 菌株收集临床分离经全自动微生物鉴定 仪鉴定的菌株包括金黄色葡萄球菌 株表皮葡萄 检测细菌蛋白表达进而 球菌 株溶血性葡萄球菌 株粪肠球菌 株屎 建立了淋球菌肺炎克雷伯杆菌及金黄色葡萄球菌的 肠球菌 株菌种保存于 冰箱 将所收集的细 快速诊断模型可对这些细菌进行快速鉴定 与传统 菌分为建模组和验证组 建模组包括 种细菌各 方法比较鉴定时间缩短了 但利用该诊断模 株其余 株为验证组 型每次只能