RAPD用于20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株亲缘性研究.pdfVIP

第24卷第2期 中国有色金属学报 2014年 2月 Vofume24Number2 TheChineseJournalofNonferrousM etals February2014 文章编号：1004．0609(2014)02．0569—08 RAPD用于20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株亲缘性研究 吴学玲，范宏伟，段 红，张真真，刘莉莉，刘新星 (中南大学 资源加工与生物工程学院，长沙 410083) 摘 要：为研究中国 20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株的基因多样性，以及基因指纹技术分类与嗜酸氧化亚铁硫杆 菌生理生化特性的相关性，使用20种随机引物，通过PCR扩增20株菌株的基因组DNA，并分析凝胶电泳条带 的有无，使用Jaccard系数和UPGMA分析菌株间相关性。20种引物产生的条带将20株菌株分成了5组，菌株问 相关性系数最小为35．I％(YTW 与DXS)，而相似系数最大为96．9％(BY-0502与DXS，DY26与DY30)。结果表明： 20株来 自不同地区的嗜酸氧化亚铁硫杆菌株具有较高的多样性，并且亲缘性分类与各菌株取样地以及最大铜离子 耐受能力分类，有较高的分类相似性，说明RAPD技术拥有在嗜酸氧化亚铁硫杆菌内分类鉴定菌株的能力。 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌；RAPD；多样性 中图分类号：Q751 文献标志码：A RAPD tostudyrelatednessof 20Acidithiobacillusferrooxidansstrains WU Xue—ling，FAN Hong—wei，DUAN Hong，ZHANGZhen—zhen，LIULi—li，L1U Xin—xing (SchoolofMineralsProcessingandBioengineering，CentralSouthUniversity,Changsha410083，China) Abstract：Tostudyhtegenomedive~iytof20AcidithiobacillusferrooxidansstrainsinChina，andtherelationship betweenhtegenomeclassificationandphysiological—biochemicalcharacteristicofAcidithiobacillusferrooxidans，DNA wasamplifiedbyPCR andwtenytrandom primers，ma plificationproductswereseparatedbygelelectrophoresisand photographedunderUVlight．TheRAPD(RandomlyAmplifiedPolymorphicDNA)profileswerecomparedonthebasis ofhtepresenceorabsenceofeachDNAbnad，andstraindiversiyt wascalculatedusingtheJaccrad’scoefficientand UPGMA (UnweightedPair-GroupArithmeticAverageClustering)clusteranalysis．Theprimersusedinthisstudy rgoupedthe20srtainsintofivemajorrgoups．Similaritiesbewteenthestrainsrangedfrom35．1％(YTW nadDXS)to 96．9％(BY-0502andDXS，DY26nadDY30)．Theseresultsindicatethathte20srtainshaveahighdergeeofgenomic diversiyt andhteRAPD markersrelated