金针菇种质资源5个农艺性状与SSR标记的关联分析.pdfVIP

／嚣‰鲢 囊●生■奠蠢■■ 1 ． ． system：http：llwwwjabiotech 2黜r《～¨…”7 麓 enilnoto净i。B org嵫y 霸聃簟 枷…农!of迷A。g赫ricultu麓ral 。热出 金针菇种质资源5个农艺性状与SSR标记的关联分析 陆欢“2+张丹P章炉军1王瑞娟1尚晓冬P+谭琦1 1上海市农业科学院食用菌研究所／国家食用菌工程技术研究中心／农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室／上海市农业遗传育种重 点实验室，上海201106；2上海海洋大学食品学院，上海201306 +同等贡献作者 ”通讯作者，xdshang@163．com 摘要金针菇(Hammulinavelutipes)是一种重要的商业化栽培食用菌，为挖掘控制金针菇重要农艺性 状的基因组区段，本研究以90份金针菇种质资源为实验材料，测定其原基期、菌柄直径、菌柄长度、菌盖 直径和单瓶产量5个农艺性状，利用全基因组序列开发的95份多态简单重复序列(simplesequence repeat，SS鼬标记对供试材料进行基因组扫描，在分析实验材料的群体结构和连锁不平衡基础上，采用一 般线性模型方法对5个农艺性状进行关联分析。结果表明，各供试材料的5个农艺性状均有极显著差 异。95份多态SSR标记共检测到582个等位变异，平均每个位点的等位变异数为6．13个。标记多态信息 information 含量(polymorphism 将供试材料分为8个亚群体，群体内SSR位点间存在较高的连锁不平衡(1inkage 衡程度Df值大于0．5的组合数占总组合数的33．01％。关联分析检测出28个标记与5个性状显著相关，其 中原基期的关联标记有2个，菌柄直径的关联标记有12个，菌柄长度的关联标记有3个，菌盖直径的关联 标记有9个，单瓶产量的关联标记有5个。关联SSR标记对表型变异解释率的变幅为5．11％～23．55％。 研究表明，所选金针菇种质资源群体的遗传多样性以及连锁不平衡程度较高，适用于关联分析研究。本 研究结果对金针菇核心种质资源库构建以及分子标记辅助育种具有参考价值。 关键词金针菇，简单重复序列(SSR)，群体结构，连锁不平衡(LD)，关联分析 AssociationofFive TraitswithSSRMarkersin Analysis Agronomic Hammulina velutipesGermplasm LUHuanl’2’ZHANGDanPZHANGLu．JunlWANGRui—JuanlSHANG Oil Xiao—Dongp’Tf气N l NationalResearchCenterforEdible and Resourcesand BiotechnologyEngineering／KeyLaboratoryofAppliedMycological Utilization， Fungi of of Geneticsand ofEdible of MinistryAgriculture／ShanghaiKeyLaboratoryAgricultural Breeding；InstituteFungi，ShanghaiAcademy ofFoodScience AgriculturalSciences，S