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三种裸腹溞的16S+rDNA序列分析与系统分类探讨.pdf

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三种裸腹溞的16S+rDNA序列分析与系统分类探讨.pdf

工如k.sci.(湖泊科学),2015,27(2):305.310 http:∥www.jlakes.o唱.E—mail:jlakes@nidas.ac.cn ⑥2015 ScieMes o,如k by如umof 三种裸腹潘的16SrDNA序列分析与系统分类探讨+ 徐敏,邓道贵“,张海军,王文平,晁秋杰 (淮北师范大学生命科学学院,资源植物生物学安徽省重点实验室,淮北235000) 摘要:为了检验已记录的3种裸腹潘(发头裸腹潘(^如iMirrmo)、短型裸腹潘(^如im6眦h缸抛)、微型裸腹潘(MDim m面mm))的系统分类,用试剂盒法分别提取3种裸腹涵的基因组DNA.利用特异性引物,通过PcR扩增了3种裸腹潘的 16s rDNA部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的裸腹潘属序列进行分析.结果表明,3种裸腹涵的平均 种间相似度为88.7%,碱基中A+T含量均明显高于G+c含量.本研究的发头裸腹潘的16srDNA序列与GenBank所下 载的多刺裸腹潘(^如i№mcrDc印。)的16srDNA序列相似度为99%,遗传距离(K2P双参考模型)为0.5%,属种内范围; 两个地区的短型裸腹滔测得的16srDNA序列与GenBank下载的欧洲短型裸腹潘的16SrDNA序列序列相似度相对较低 (88%~90%),遗传距离较大(13.2%一13.5%左右),已达到属内种间分化水平.基于16srDNA构建的NJ树和贝叶斯树 也支持以上结论.结果表明,本研究的发头裸腹泾可能为多刺裸腹溪,本研究用的短型裸腹潘与GenBank下载的欧洲短 型裸腹潘已经达到种间分化的标准.由于缺乏物种形态资料和其他分子标记的对比,3种裸腹潘的分类地位还需进行更 深入的探讨. 关键词:裸腹搔;16SrDNA;系统分类 MOIecuIar 0fthree^4Df几abasedOn16SrDI、JA phylogeny species genesequences xu Min,DENGDaogui,zHANGHaijun,wANGwenpillgcHAOQiujie Anhui nnEPlam N。珊nl t X叼kbomfoq研Re∞Mrce8iolo野,sc沁ol西L啦sc娩粒e,HllnibetUnivers匆,H姗扬ei235蝴, P.R.Chmn) orderto the class诳cationd recor_ AbStract:Inexamine systematlc ded DNAof wereextmctedthekitmetllod.PCRwasusedto se— previously,genomicthree胁i,批8pecies thmugh amplifypanial of1 rDNAof same with mteofeach 6S three胁讥o quences speciesbyemployingspecmoPIimers,andsequencehighermatching f南mtheGenBankwere on16S rate threeMo抽皿 肘。机凸species analysed.BasedrDNA,theaverageinterspecificsimila五tyamo“g was thecontentofA+Twas thatofG+C.rI}le ofMir,琊Ⅱint}lis and species88.7%,and obviouslyh培herthaJl siTIlilarity study fromtheGenBankwas ratewas a ofs姗e 0f 肘.瑚∞印8

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