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cDNA文库组标准流程一(Total RNA的提取)
中国试剂网 3.20.1.9
cDNA 文库组标准流程一(Total RNA 的提取)
1.试剂配制
准备工作:
1、研钵、5ml/10ml/ 25ml 移液管、100ml/250ml 量筒、250ml/100ml 容量瓶、药
匙、 试剂瓶等玻璃制品均用锡纸包裹口部,置于烤箱内,180℃,烤6 小时。
2 、50ml/1.5ml 离心管、枪头等塑料制品用 0.1‰DEPC 水浸泡过夜后,121℃
20mins 高压灭菌。
3、电泳槽及电泳托、梳子用3%双氧水处理。
4 、常用试剂及其配方:
▲DEPC 水:在1000ml 去离子水中加入100ul DEPC, 静置过夜后高压灭菌。
▲0.78M 柠檬酸纳:PH=4~5
三水合柠檬酸纳 22.94g
加DEPC 水定容至100ml,室温放置备用。
▲10%肌氨酸钠:
肌氨酸钠 10g
加DEPC 水定容至100ml,室温放置备用。
▲变性裂解液:
0.78M 柠檬酸钠 8.25ml
10%肌氨酸钠 12.375ml
异硫氰酸胍 118.05g
加DEPC 水定容至 250ml ,室温放置备用
临用前加β-巯基乙醇使其终浓度为1% (v/v )
▲ 2M 醋酸钠 PH=4.5
NaAc·3H2O 13.6g
加DEPC 水定容至50ml,高压灭菌,室温放置备用
中国试剂网 3.20.1.9
▲3M 醋酸钠 PH=5
NaAc·3H2O 20.4g
加DEPC 水定容至50ml,高压灭菌,室温放置备用
▲ 4M LiCL:
LiCL 24.164g
加DEPC 水定容至100ml,高压灭菌,室温放置备用
▲0.5M EDTA PH=8.0
EDTA 18.61g
用NaOH 调PH 值至8.0,定容到100ml,高压灭菌,室温放置备用
▲10X MOPS (3- (N- 吗啉代)丙磺酸):
MOPS 41.86g
NaAC·3H2O 4.10g
0.5MEDTA (PH 8.0 ) 20ml
用NaOH 调PH 值 6.5 , DEPC 水定容到1L,室温避光放置备用。
▲ 1x MOPS:
10x MOPS 30ml
加DEPC 水270ml ,用时现配。
▲4x RNA Loading buffer:
10x MOPS 400ul
甘油(高压过) 200UL
溴酚兰 10ul
甲醛(37%) 72ul
去离子甲酰氨 310ul
EDTA(0.5M PH 8.0) 8ul
ErBr(10mg/ml in DEPCH2O) 70ul
在4 ℃ 可保持3 个月
▲ 10x PBS
pH=7.4
中国试剂网 3.20.1.9
NaCl 80g
KCl 2g
Na2HPO4 14.4g
KH2PO4 2.4g
定容至 1000ml
▲变性电泳胶:
称取0.5g 琼脂糖,加入47.5ml 1x MOPs ,加热至琼脂糖熔化后,冷却至50℃左
右,加入2.5ml 甲醛,轻轻混匀后倒入电泳托上。
▲变性电泳缓冲液:
在250ml 容量瓶内加入5ml 甲醛,用1x MOPS 定容至250ml
2.动物组织total RNA 的提取
1. 根据表 1 选择适当的组织量和相应的变性裂解液量,将变性裂解液分装
到RNase-free 的50ml 无菌离心管中,冰浴5 分钟。
2 . 将组织样品放入变性裂解液中,在高速下匀浆 15-30 秒/次,直到看不见
组织和细胞碎片。
3 . 根据表1 加入适量2M 的乙酸钠(pH4.0 ),反复颠倒混匀4-5 次。
4 . 根据表1 加入适量酚/氯仿,加盖
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