舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析.pdfVIP

重庆医科大学学报2011年第 36卷第 1O期 fJournalofChongqingMedicalUniversity2011．Vo1．36No．10) 一 1233 一 拇 DOI：10．39696．issn0．253-36262．011．10．023 舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析 邹 波，季 平，孙守娟，漆小娟 (重庆医科大学附属 口腔医院颌面外科 ，重庆 400015) 【摘 要】目的：对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressedsquencetag，EST)进行电子克隆 及序列分析。方法：利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核 酸序列和蛋白质序列分析。探索克隆差异表达基因的研究方法和策略。结果：通过电子延伸得到 1个 1705bp的cDNA序列； 核酸序列分析显示，该 cDNA定位在 1号染色体 ，含有 1个编码 146个氨基酸的完整开放阅读框；对氨基酸序列进行结构域预 测显示其存在 1个与Translin超家族同源的区域；BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关