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论文题且：基于}1盯频率的lail姒识别方法研冤 学科专业：基础数学 学位申请人：唐琳燕 指导老师：王军教授 摘 要 生物信息学是建立在数学、计算机科学和生命科学等学科基础之上的一门交 叉学科，包含了生物信息的获取、加工、存储、分配、分析、解释等在内的各个 方面。生物信息学的研究内容十分广泛，其中，非编码RNA的研究是目前热门 的研究课题之一。生物体中RNA分为编码蛋白质RNA和非编码蛋白质RNA两 类。研究表明，非编码RNA基因比翻译蛋白更易产生功能性RNA产物，它包 含许多功能重要的RNA，其中，长度在20--30个碱基范围内的称之为小RNA。 非编码小RNA大量存在于高等生物体内，组成了十分复杂的生物调控网络。到 目前为止，人们在真核生物中已发现了三类非编码小RNA：微小RNA(miRNA)， 和鉴定可以采用实验分析(包括克隆和测序、miRNA微阵列以及杂交实验)和 计算分析(包括基于决策树和机器学习如k-gram，支持向量机，贝叶斯网络等) RNA)是一种新型的小RNA，它的长度一 两种方法。piRNA(PlWI．interacting 般为25-+32个碱基。piRNA存在于许多物种当中，比如人类，大鼠，小鼠，果 蝇等等。找到一种有效、可信度高的预测人类piRNA的方法很有必要。 本文中，我们使用所有l~4字(共340个)的频率来表示人类的piRNA序 列，并对每个特征向量进行正规化处理，然后利用支持向量机以及五轮交叉验证 来进行预测，结果显示这种方法对预测人类piRNA是很有效的。 关键词：生物信息学；非编码RNA序列；miRNA；piRNA：k字串；支持向量 机 k--ler Title：Predictionof basedonrelative of strings piDL^s colposition mmthematics gajor：Basic DegreeApplicant：TangLinyan Tutot：Professor WangJun Abstract isa basedon Bioinformatics mathematics，computer cross-discipline scienceandlifescience includesall ofthe ete，which aspectsbiological informationsuchas and researchcontentofbioinformaticsisvery interpretation,etc．The RNAs ofthemost research isone topics． extensive．Non-Coding popular and RNAsin RNACanbedividedinto RNAs encoding non—coding showsthat RNAs a non-codinggenesproduce organism．Research thanatranslated functionalRNA rather