深度测序数据表现和交换的全能格式及编辑工具.pdf

深度测序数据表现和表换的全能格式及其编辑工具 中文摘要 深度测序数据表现和交换的全能格式及其编辑工具 中文摘要 随着下一代测序技术的飞速发展，产生了数以万计的数据，下游的分析软件也呈 指数增长。然而，这些软件之间的标准不统一，往往定义了自己的数据格式。因此， 在多个软件间进行数据交换就显得尤为困难。本文为解决这个难题，从两个层次逐步 深入。首先，开发出了一款界面友好，功能强大的数据格式转换软件。但是，数据格 式转换仍然存在诸多问题，如数据丢失，耗费时间等。接 ，本文提出了一种用于下 一代测序的通用数据格式NGSML。使用NGSML格式就可以解决大量数据间的交换 与显示问题，极大地方便研究人员将精力专注于所研究的核心问题上，而忽略数据格 式转换等繁琐的问题。同时，为了便于NGSML格式的操作，我们开发出了一款易于 使用的编辑软件，方便用户编辑和展示NGSML文件。最后，本文将NGSML格式应 用到了具体的问题中。在POMA软件的数据存储中使用了NGSML数据格式，展示 NGSML格式的强大功能和高度的可扩展性。 关键词：下一代测序，数据格式，格式转换