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三种绿藻的IT和18SrDNA序列及系统发育分析.pdf
三种绿藻的ITS和18SrDNA序列及系统发育分析 摘要
摘 要
(Monostroma
区(ITS)和编码区18SrDNA的序列全长。测序后的产物用ClustalX程序进行分
析,然后用BioEdit整理拼接序列。并将这三种绿藻的ITS和18SrDNA序列与从
软件中的Kimura双参数模型计算碱基的组成、种间的遗传距离和序列的比值差异。
method)计算不同物种间的关
再运用MEGA3.1软件中的邻接法(neigbor-joining
19种绿藻之间系统发育的亲缘关系。
尽管孔石莼(U
pertusa)的叶状体宽厚、有很多孔,并且在形态学与浒苔(U
rDNA系统进化树上看,孔石莼和浒苔是在一个分
prolifera)差异很大,但是从18S
支中。虽然ITS系统进化树中,孔石莼和浒苔不在一个分支中,但是它们都在一个
大簇中。不论是ITS系统进化树还是18SrDNA系统进化树,都可以明显的看出石莼
致【78l。本研究从而也证明了,不同的地域得出来的石莼科组成的结论是一样的。
rDNA,ITS,序列分析,系统发育
关键词:浒苔,孔石莼,格氏礁膜,18S
作 者:林子杰
指导教师:沈颂东
and ofITSand18S
Analysis
SequencesPhylogeny
rDNAofThree in
Chlorophyta
Species
Abstract
We theoverall ofITS and18SrDNA aboutUlva
got length region sequences
andMonostroma were
prolifera,Ulvapertusa grevillei.Thesequencesalignedusing
Clustal further BioEdit.For
X,and manuallyadjustedusing comparativeanalysis,other
16 weretakenfromtheGenBankwere withU
greenalgasequences comparedprolifera,
U used the
and膨grevillei.We method)tostudy
pertusa MEGA3.1(neighbor-joining
ofdifferenttoconstructthe detectthe
species tree,and degree
relationship
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