3种棱型大麦中脱水素6(DHN6)的性质、突变位点蛋白质进化的分析.pdfVIP

基 因组学与应用生物学，2011 年，第 30 卷，第 3 期，第 322-329 页 GenomicssandsAppliedsBiology,s2011,sVol.30,sNo.3,s322-329 研究报告 AsLetter 3 种棱型大麦中脱水素 6s(DHN6)的性质、突变位点与蛋白质进化分析 钱刚 1* 平军娇 1 张珍 1 王乾兴 1 刘茂生 2 1 遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室,s遵义,s563000;s2 遵义医学院解剖学教研室,s遵义,s563000 * 通讯作者,spengjiaqiong@163.com 摘 要 脱水素(dehydrins,sDHNs)是高等植物胚胎发育晚期产生的一类特异多肽，能够逆转细胞脱水所造 成的伤害。 为明确脱水素性质与功能的关系，本研究从 3 种棱型大麦分离到 Dhn6 基因，生物信息学分析其 编码的蛋白质序列长度分别为 523 个(六棱) 、502 个( 四棱)和 486 个(二棱)氨基酸残基；氨基酸突变位点分析 发现该基因具有整体保守性和突变位点偏倚性。蛋白质性质与二级结构分析表明，DHN6 是高度亲水的碱性 蛋白质，线性结构和自由卷 曲为二级结构的主要组分，K- 片段参与 α- 螺旋结构的形成，由此推测 DHN6 的 兼性 α- 螺旋结构域在稳定膜结构的水合保护体系过程中发挥着重要的生理功能 。 构建的 21 个物种 DHN6 蛋白质系统发生树，发现禾本科植物遗传距离较近，结合核苷酸序列的物种特异性，本研究认为 Dhn6 基因 可作为物种鉴定依据。 关键词 大麦,KDhn6 基因,s序列比对,s二级结构,s系统进化 AnalysissofsCharacters,sMutatantsSitessandsEvolutionsofsProteinsofsDehydrins 6s(DHN6)sins3sTypicalsRowedsBarleys QiansGangs1* PingsJunjiaos 1 ZhangKZhenK 1 WangKQianxingK 1 LiuKMaoshengK2 1KDepartmentKofKCellKBiologyKandKGenetics,KZunyiKMedicalKCollege,KZunyi,K563000;K2KDepartmentKofKAnatomy,KZunyiKMedicalKCollege,KZunyi,K563000 *KCorrespondingKauthor,Kpengjiaqiong@163.com DOI:K10.3969/gab.030.000322 Abstract DehydrinsK(DHNs),KaKspecialKpolypeptideKgeneratedKinKlateKembryogenesisKofKhigherKplants,KcouldKpro- tectKtheKplantsKfromKtheKdamageKcausedKbyKcellKdehydration.KInKorderKtoKlearnKtheKrelationshipKbetweenKcharacteris- ticsKandKfunctionsKofKdehydrins,KweKextractedKDhn6 genesKfromK3KtypicalKrowedKbarleys,KandKusedKbioinformaticsK analysisKtoKfindKtheirKencodedKproteinsKwereKcomposedKofK523K(six-rowedKbarley),K502K(four-rowedKbarley)KandK486K (two-rowedKbarley)KaminoKacidKresidues,Krespectively.KFurthermore,KweKfoundKthereKwereKwholeKconservativeKtraitsK andKmutantKsitesKspecificityKinKthisKgeneKbyKanalysisKofKaminoKacidKmutations.KAnalysesKofKcharacteristicsKandKsec- ondaryK structureK indicatedK thatK DHN6K consistedK ofK highlyK hydrophilicK alkalineK proteinsK primarily,K andK theK s