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《Linux操作系统》上机实验指导
适用专业:生物信息学
编写:解增言
生物信息学院
2013年9月
课程说明
一、课程名称:Linux操作系统基础
二、总课时数:48 学时(理论32学时,实验16学时)
三、先修课程:计算机基础
四、课程教材:
解增言. Linux操作系统基础上机实验指导. 2012
五、上机实验要求:
本课程的上机实验要求:
(1)掌握Linux系统的基本操作和VI编辑器的使用;
(2)了解Linux环境下Perl语言的编写,C语言的编写、编译及运行方法;
(3)掌握Shell编程的基本语法;
(4)掌握命令历史、环境变量、管道、重定向的概念及使用方法;
(5)能熟练运用Shell脚本程序处理生物数据。
六、考核方式:
平时成绩(考勤、平时表现等):50%
实验报告:50%
目录
实验一 Linux常用命令练习 3
实验二 vi编辑器练习 14
实验三 Shell程序设计基础 20
实验四 Shell程序开发实例:PubMed文献批量下载程序 26
实验一 Linux常用命令练习
一、实验目的
1. . 掌握帮助、进程管理、压缩解压缩、网络连接与文件传输及其它命令;
二、实验环境
1. 操作系统:客户端Windows,服务器端Linux
2. 主要软件:putty
三、实验原理
1. 文件内容查看
(1)cat
[功能]
显示文件内容
[命令格式]
cat [option] [file]
[常用选项]
[其它用法]
新建文件:$cat EOF file
合并文件:$cat file1 file2 file3
管道用法:$cat file |sort
(2)zcat
[功能]
显示压缩文件内容
[命令格式]
zcat [option] [file]
[常用选项]
(3)
显示文件尾部内容
[命令格式]
tail [option] [file]
[常用选项]
-n number或-number:显示最后number行
(5)more
[功能]
分页显示文件内容
[命令格式]
more [option] [file]
[常用选项]
(6)less
[功能]
分页显示文件内容(功能比more强大)
[命令格式]
less [option] [file]
[使用技巧]
①搜索
当使用命令 less file-name 打开一个文件后,可以使用下面的方式在文件中搜索。搜索时整个文本中匹配的部分会被高亮显示。?
向前搜索
/ - 使用一个模式进行搜索,并定位到下一个匹配的文本
n - 向前查找下一个匹配的文本
N - 向后查找前一个匹配的文本?
向后搜索
? - 使用模式进行搜索,并定位到前一个匹配的文本
n - 向后查找下一个匹配的文本
N - 向前查找前一个匹配的文本?
②全屏导航
ctrl + F - 向前移动一屏
ctrl + B - 向后移动一屏
ctrl + D - 向前移动半屏
ctrl + U - 向后移动半屏?
③单行导航
j - 向前移动一行
k - 向后移动一行?
④其它导航
G - 移动到最后一行
g - 移动到第一行
q / ZZ - 退出 less 命令⑤其它有用的命令
v - 使用配置的编辑器编辑当前文件
h - 显示 less 的帮助文档
pattern - 仅显示匹配模式的行,而不是整个文件mv [option] source_file target_file
[常用选项]
-f:如果目标文件已存在,不提示直接覆盖
-i:覆盖之前提示
(3)rm
[功能]
删除文件或目录
[命令格式]
rm [option] file
rm –r directory
[常用选项]
-f:如果目标文件已存在,不提示直接覆盖
-i:覆盖之前提示
-r:删除目录及其中的内容
(4)ln
[功能]
建立连接
[命令格式]
ln [option] file link
[常用选项]
-s:建立软连接
(5)touch
[功能]
修改文件或目录的时间戳
[命令格式]
touch [option] file
[常用选项]
-t stamp:使用时间(格式[[CC]YY]MMDDhhmm[.ss])代替当前时间戳
[其它用法]
生成新的空文件(touch后面的文件不存在的话)
(6)chown
[功能]
修改文件或目录的属主
[命令格式]
chown [option] user file
[常用选项]
-R:修改目录及其中的所有文件和目录的属主
(7)chmod
[功能]
修改文件或目录的权限
[命令格式]
chmod mode file
[常用选项]
-R:修改目录及其中的所有文件和目录的权限
[示例]
chmod 755 at_cds
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