ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中应用.pdfVIP

畜牧与饲料科学 —A—～nimal．H+。——u—s——ba．．．—r，u．．．t．r．—y——a——n．．，d．．—．．．F．—e—e—d—S．．．c．．—ie—w————e 2009。30(I)：52—53 ==二———～ 一一 ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用 白树猛．田黎 (青岛科技大学生物系，山东青岛 266042) 摘要：笔者介绍了ITS序列结构特点，综述了ITS序列在植物病原真菌分类鉴定和分子检测中的应用，并对其应用前景 进行了展望。 关键词：ITS：分类鉴定：分子检测 中图分类号：Q949．32；Q522．6 文献标识码：A ofITS inClassificationandIdentificationandMolecularTestof ApplicationSequences Fungi BAI al Shu—meng．et of (BiologyDepartment，QingdaoUniversityScienceTechnology，Qingdao266042．China) intrmtucedIIS structural the intheidentifica— Abstract：The characteristic，summarizedofITS paper sequence applicationsequences tionandmoleculartestof its was forward． fungus．And put plantpathogenic appliedprospect test words：IIS；classificationandidenti6catjon：molecular Key transcribed 真菌核糖体基冈转录间隔Ⅸ(intemal spacer于营养体和子实体的形态学特征并结合其生理生化性状的描 I幅)，又叫内转录间隔区，是位于真菌核糖体DNA(rDNA)述。但是真菌形态特征容易受到培养条件和其他因素的影响． 上18S和28S基因之间的区域片段．主要包括内转录间隔而且许多子实体类型经常难以获得，传统的分类方法不能满足 区1(ITSl)、5．8SrDNA、内转录问隔区2(ITS2)，其两侧分别某些菌种的分类要求。由于ITS的序列分析能实质性地反映出 是18SRNA基因和28SRNA基因。虽然ITSl和ITS2是核属间、种问以及菌株间的碱基对差异。此外ITS序列片段较小。 糖体转录单位中的一部分．但这些序列并不转录成RNA，它 人们可以从不太长的序列中获得足够的信息，易于分析。目前 们只是在核糖体RNA成熟过程中起着重要作用…。 已被广泛应用于真菌属内不同种间或近似属间的系统发育研 rDNA在种内由于基冈的流动而经常表现_}I{很高的同究中跚。唐建辉等6根据核糖体转录间隔区ITS的通用引物 源性，在种间则保持着各种程度的变异。变异的多少能够反 映生物进化上属内种间亲缘关系的远近。最常见的变异是 ITS上的单个碱基的替换，其次是碱基的插入或缺失。与核 建立ITSl、ITS2聚类分析阁，探讨炭疽属的系统发育情况。陈 糖体DNA中的18S、5．8S和28S的基闲组序列相比较．ITSl玉玺17j等探索镰刀菌