水稻株高QTL定位及精确性分析.pdfVIP

维普资讯 第 47卷 第 1期 厦 门大学学报 (自然科学版) Vol_47 No．1 2008年 1月 JournalofXiamenUniversity(NaturalScience) Jan．2008 水稻株高 QTL定位及精确性分析 张志勇，黄育民，张 凯，王侯聪 ，江 良荣 (厦门大学生命科学学院，水稻遗传育种课题组，福建 厦门361005) 摘要 ：分别应用具有 127和 131个标记位点的 “广佳”(广陆矮4号×佳辐 占)和 “明佳”(明恢86×佳辐占)重组自交系 群体，利用复合区间作图法 (CIM)对水稻株高数量性状位点 (QTL)进行检测和效应分析．为保证 QTL定位精确性，采用 排列试验法确定每一群体的LOD阀值．结果显示 ：排列测验法是一个十分有效的阀值推断统计方法 ，两个群体 L0D阀 值分别为 2．8和 2．7．“广佳”群体共检测到 5个加性 QTL，位于第 1、6、7、8和 11染色体 的5个 区间，单位点贡献率在 5．31 ～48．35％之间；“明佳 ”群体共检测到 4个加性 QTL，位于第 3、5、9和 12染色体的 4个区间，单位点贡献率在 7．56 ～11．50％之间．同时利用混合线性模型复合区间作 图法 (MCIM)在两群体各检测到 1对上位性 QTL．作者从实 验设计和数据分析方面对 QTL定位精确性进行 了讨论 ，为今后数量性状遗传研究提供有益借鉴． 关键词 ：水稻；株高；数量性状位点；排列试验法；定位精确性 中图分类号：S511 文献标识码：A 文章编号：0438—0479(2008)01—0116—06 株高 (Plantheight，PH)是水稻一个十分重要的 中水稻株高QTL数 目相对庞大而定位真实性却难以 农艺性状，与品种抗倒伏 、抗病虫害、光合强度和丰产 保证的一个重要原 因．同时上位性效应和 QTL与环 潜能等诸多因素密切相关[1]．自2O世纪 5O年代末， 境互作 (QTL×Environmentinteraction，QEI)作为数 水稻矮化育种使稻米产量取得突破性增长以来 ，育种 量性状遗传的重要组成部分 ，能对其进行有效无偏地 工作者 已对株高进行了广泛的遗传研究，水稻株高遗 评估也是数量性状遗传研究的一个十分重要的组成部 传总体上被认为是质量一数量性状遗传 [32．通过经典遗 分． 传学的方法至少有 6O多个矮杆和半矮杆基因已被鉴 本研究依靠 自身数据，通过排列试验法(Permuta— 定 ． tiontest)[1。]确定各 自群体 的 LOD 阀值．基于各 自 2O世纪 8O年代末，随着分子标记技术的发展及 LOD阀值 ，应用复合 区间作图法 (Compositeinterval 遗传统计分析软件的开发和应用，人们对控制水稻株 mapping，CIM)[11]对两群体不 同环境下的株高 QTL 高数量性状位点(Quantitativetraitlocus，QTL)做了 进行检测和效应分析，并应用混合线性模型复合 区间 大量 的研 究．根据 Gramene数据库 (http：／／www． 作 图法 (Mixed—modelbasedoncompositeinterval gramene．org／qt1)最新公布 的数据 ，目前水稻株高 已 mapping，MCIM)L1。]对 QTL之 间的互作效应进行分 定位到 959个 QTL，分布于 12条染色体上．但是各研 析 ，解析水稻株高性状遗传基础．最后作者对 QTL定 究的定位结果却不尽一致，主要表现在不 同研究的 位精确性及其影响因素从作图群体、位点间互作、环境 QTL定位数 目、染色体上的分布不一致 ，同一 QTL的 效应，定位所选阀值和分析方法等方面进行了讨论 ，为 效应值及贡献率差别较大等 ]．其原因可能是多方