葡萄球菌诱导斑鱼皮肤免疫相关基因差异表的的研究.pdfVIP

摘要 鱼类皮肤黏膜是黏膜免疫系统的重要组成部分，越来越多的研究表明鱼类皮 肤黏膜可独立完成抗原摄取、递呈及分泌抗体等功能，在鱼类抵抗外来病原侵袭 方面发挥着极其重要的作用，但其在免疫应答过程中表达的免疫相关基因目前尚 不完全清楚。本研究的总体思路是利用基因芯片技术检测经致死剂量产色葡萄球 菌处理和未处理的斑马鱼 (Danio rerio) 皮肤，检测和分析感染后斑马鱼免疫应 答早期皮肤组织差异表达基因，以挖掘出斑马鱼皮肤免疫早期相关功能基因的详 实数据信息，为研究鱼类皮肤黏膜的免疫机制和研发浸泡免疫疫苗奠定基础。 首先，从草鱼肠道分离鉴定致病性产色葡萄球菌，为后续试验提供菌种。采 用常规细菌分离培养方法结合人工感染试验从草鱼肠黏膜分离获得一株致病菌， 命名为 SC1 菌株。根据其染色特性和菌落特征进行初步鉴定；然后采用分子生 物学方法，对其 16S rRNA 基因和过氧化氢酶基因 (kat) 进行扩增和序列分析。 结果表明，该菌为 G+球菌，呈葡萄串状排列，无荚膜和芽孢，其生化特性等与 葡萄球菌属 (Staphylococcus) 相吻合，分离菌株 16S rRNA 基因和 kat 基因 PCR 扩增产物分别为 1520bp 和 1232bp，序列分析分析表明它们在遗传距离上与产色 葡萄球菌 (Staphylococcus chromogenes) 最为接近，从而 SC1 菌株为产色葡萄球 菌。 其次，建立实验动物斑马鱼的感染模型。以斑马鱼为实验动物，感染剂量、 时间为参数，进行产色葡萄球菌人工感染斑马鱼试验，通过观察感染后斑马鱼的 发病死亡情况以及组织病理学变化，确定其最佳感染条件。结果发现以 8 10 CFU/mL 菌液浓度浸泡感染 10min 后斑马鱼的活动状态比较一致，出现了游 动缓慢和浮头现象，并且死亡时间相对较为集中。病理学变化主要表现为肾脏细 胞坏死、核内染色质浓缩、染色加深并伴有炎症细胞浸润；肝脏细胞排列疏松、 染色加深、伴有炎症细胞浸润。由此可见，该感染条件是产色葡萄球菌人工感染 斑马鱼的最佳条件。 最后，以斑马鱼感染模型为研究对象，利用基因芯片技术从皮肤组织中抽提 总 RNA ，经生物素 (Biotin) 标记后，与包含 15617 个 cDNA 探针的斑马鱼表达 谱基因芯片杂交，在斑马鱼免疫应答早期，检测皮肤免疫相关差异表达基因，并 进行功能聚类、注释分析和通路分析。结果共检测出 272 个差异表达基因，其中 210 个为上调表达基因，62 个下调表达基因。利用 NCBI 、MAS 等数据库对差异 基因进行功能聚类和注释分析，结果显示 272 个差异表达基因中，134 个为已知 功能基因，具有免疫功能的基因有 10 个，主要包括凝集素基因 (lgals1l3 ）、组 织相容性复合体 (mhc1uea 、mhc1ufa) 、谷胱甘肽氧化物酶基因 (gpx 1b) 、转铁蛋 I 白基因 (tfa) 、凝血因子 (f5 ) 、硒蛋白基因 (sepw2b) 、补体 (cfb) (均为上调表达) ； 肿瘤坏死因子基因 (tnfsf10l4) 和卵黄蛋白原基因 (vtg3) (均为下调表达) 。它们涉 及的免疫反应包括病原体识别、抗原加工与提呈、补体激活和特异性免疫应答。 通路分析结果显示 p53 信号通路、ErbB 受体信号转导通路和 JAK-STAT 信号转 导通路等 9 个通路均参与斑马鱼皮肤抗产色葡萄球菌感染。 综上所述，本研究挖掘出 10 个经产色葡萄球菌诱导后的斑马鱼皮肤组织免 疫相关的差异表达基因，明确了这些免疫相关基因参与的免疫反应。 关键词：斑马鱼皮肤黏膜，基因芯片，差异表达，免疫相关基因 II Abstract Fish skin is an important part of mucosal immune system. More and more evidence showed that f