世界栽培豌豆(Pisum sativum L.)资源群体结构与遗传多样性分析.pdfVIP

中国农业科学 2010,43(2):240-251 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.02.003 世界栽培豌豆(Pisum sativum L.)资源群体结构 与遗传多样性分析 宗绪晓，关建平，王海飞，马 钰 （中国农业科学院作物科学研究所/ 国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程，北京 100081 ） 摘要： 【目的】评价国家种质库长期保存的国内、外栽培豌豆（Pisum sativum L.）资源的遗传多样性水平， 揭示其遗传多样性、等位基因和群体结构差异，据此评估其重要程度及价值，为中国豌豆资源研究策略和方向的 正确选择、国内外资源的充分发掘利用和深入研究提供理论依据。【方法】利用21 对豌豆多态性SSR引物，对来 自国外五大洲66个国家和中国28个省（区、市）的1 984 份栽培豌豆进行SSR标记遗传多样性和群体结构分析； 采用 Structure 2.2 软件完成资源群体结构剖析、推断参试材料的合理组群数、确定每份参试材料的适当群体划 入及其相关参数计算；利用NTSYSpc2.2d软件估算其遗传距离，进行主成分分析（PCA）并绘制三维空间聚类图； 采用 Popgene V1.32 估算种质群的等位位点分布等参数，利用 Fstat V 进行种质群间遗传多样性差异显 著性测验。【结果】通过对国、内外栽培豌豆资源群间 SSR 等位基因数（NA ）、有效等位基因数（NE ）、有效等 位基因所占比重（NE/NA ）、等位基因丰度（AR ）、基因多样性指数（GD ）、Shannons信息指数（I）的比较，发 现除等位基因数（NA ）外，国内资源的其它5个遗传多样性指标全面高于国外资源。在21个SSR基因位点中，国 内、外资源群在 7 个位点间存在等位基因种类的差异。群体结构分析将 1 984 份世界栽培豌豆资源划分成三大组 群。组群 A 包含 96.49%的国外栽培豌豆参试资源，可代表典型的国外栽培豌豆资源类型；组群 B 的资源 88.18% 来源于陕西和内蒙古，可代表中国典型的春播区栽培豌豆资源类型；组群C的资源52.05%源于中国秋播区，47.44% 源于中国春播区，可代表中国秋播区和除陕西、内蒙古外的春播区栽培豌豆资源类型。组群间遗传多样性差异达 到显著水平。PCA作图分析也明确显示世界栽培豌豆资源群体中存在3 个边界明显的资源富集区（基因库I、II、 III），且与三大组群的群体结构分析结果精确对应。【结论】国内资源的遗传多样性程度整体上超过国外资源， 国外资源群体内个体间的差异程度平均高于国内资源。群体结构分析侦测到世界栽培豌豆资源中存在 A、B、C 共 三大资源类群，类群间的遗传多样性差异达到了显著水平，且与 PCA 做图分析显示的 3 个边界明显的基因库间存 在着精确对等关系：“类群A”几乎等同于“基因库I”，“类群 B”几乎等同于“基因库II”，而“类群C”几 乎等同于“基因库III”；基因库I由国外资源富集而成，基因库II由中国陕西和内蒙古资源富集而成，基因库 III 由中国秋播区资源和陕西、内蒙古以外的春播区资源富集而成，由此得出世界栽培豌豆由 3 个基因库构成的 结论。国外栽培豌豆种质资源构成了“基因库I”，国内栽培豌豆种质资源构成了“基因库II”和“基因库III”， 表明国内、外资源均很重要，但国内资源甚于国外。 关键词：豌豆（Pisum sativum L.）；种质资源；SSR；遗传多样性；群体结构；基因库 Population Structure and Genetic Diversity of Global Pea (Pisum sativum L.) Germplasm Resources ZONG Xu-xiao, GUAN Jian-ping, WANG Hai-fei, MA Yu (Institute of Crop Sciences/The National Key Facility for Crop Gene Resour