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- 2016-03-02 发布于贵州
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小鼠着床位点基表达系列分析
摘要
摘要
胚胎着床涉及胚胎和子宫之间一系列复杂的相互作用,许多基因参与其中。尽管已利用
寡核菅酸芯片、cDNA芯片、DDRT--PCR等各种不同的技术筛选到一些着床相关基因,但
胚胎着床的机制仍不清楚。为了全面了解胚胎着床相关分子和发现新的胚胎着床相关信号通
路,我们首次应用基因表达系列分析(SAGE)技术,分析了小鼠早期妊娠第五天非着床位
点和着床位点子富的基因表达谱。
我们利用早期妊娠小鼠第五天的子宫分别构建了非着床位点和着床位点标签长10bp的
两个SAGE文库,非着床位点测序的标签数为51306个,对应16964个特异标签,着床位点
测序的标签数为53214个,对应16733个特异的标签。为了提高SAGE库中标签对应基因的
比例,我们利用同一个SAGE文库的序列文件,构建了标签长11bp的两个文库,非着床位
个特异的标签。共有1039个标签在非着床位点特异性表达,1252个标签在着床位点特异性
表达。根据P值,195个标签在非着床位点显著上调,其中100个标签是单一匹配的,261
个标签在着床位点显著上调,其中127个是单一匹配的。
为了验证SAGE结果的可信性,我们随机选取14个单一匹配的标签对应的基因(其中7个
的表达趋势一致。我们利用原位杂交对SAGE结果也进
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