圈养大熊猫食性换期肠道菌群的多样性研究.pdfVIP

IRillIlllllllllUliii III JO121412 基金项目 国家自然基金面上项目 大熊猫国际合作资金项目 (SD0632) 万方数据 摘要 食性转换期是大熊猫一生中的重要时期。圈养条件下，10月龄左右的亚成 年大熊猫进入食性转换期，该阶段是大熊猫由高蛋白饮食(如母乳或牛奶等)向 以竹类等高纤维素食物为主食的转化过程。一些研究己证明食物的转换会影响肠 道微生物的组成以及宿主的抵抗力，并且大熊猫肠道菌群在降解含高纤维素的竹 子中扮演了重要的角色。 为了探究圈养大熊猫食性转换期肠道菌群的多样性，本实验采用ERiC—PCR 指纹图谱技术筛选出肠道菌群多样性高的样品，并对筛选出来的样品构建16S rDNA克隆文库，采用限制性内切酶HinfI和Msp FragmentLengthPolymorphism)及测序分析。研究结果如下： 1．对3只大熊猫在食性转换期的粪便细菌总DNA进行ERIC—PCR指纹图谱 分析，通过图谱相似性及多样性筛选出多样性较高的样品(F6、F7、G8、J9、 G10、J11、J12)。 2．通过构建食性转换期大熊猫肠道菌群的克隆文库及对文库进行RFLP分 析，共获得787个阳性克隆子，产生224个OTUs。构建的文库覆盖率都大于 78．5％，说明所构建的克隆文库具有良好的代表性。Shannonindex(H’)，Simpson 丰富，且食性转换前期和食性转换后期大熊猫肠道菌群的多样性高于食性转换中 期。 3．16SrDNA序列分析发现食性转换期大熊猫肠道菌群归为硬壁茵门、变形 菌门、拟杆菌门、梭形杆菌以及未培养细菌。其中硬壁菌门和变形菌门是大熊猫 整个食性转换期的优势菌群。在大熊猫食性转换期中，482个序列属于＆一，丫一和 ￡．变形菌门(在整个序列中占61．25％)，并且这些序列归为17个细菌属。241个 序列属于硬壁菌门(在整个序列中占30．62％)，并分布在10个细菌属中。它们 随着食性的转换其比例也发生变化。在硬壁菌门中，优势菌群是梭菌属和球菌属； 在变形菌门中，优势菌群是埃希氏菌属和醋杆菌属。 关键词：大熊猫；食性转换期；菌群多样性；粪便 万方数据 from theBacterial inFaeces Characterizationof Diversity Period Panda DietConversion Giant during Captive VeteribaryMedicine) YongjiuLuo(Clinical Directed and PengZhijunZhong byGuangneng ABSTRACT Dietconversionisa for conditions，the periodspecialstagegia