Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice.pdfVIP

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2016-03-09 发布于山东
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Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice.pdf

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A rt i c l e s Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces 1,2,10 3,10 4,10 1,2,10 1,10 1 1 Xuehui Huang , Xinghua Wei , Tao Sang , Qiang Zhao , Qi Feng , Yan Zhao , Canyang Li , 1 1 5 5,6 1 1 1 1 Chuanrang Zhu , Tingting Lu , Zhiwu Zhang , Meng Li , Danlin Fan , Yunli Guo , Ahong Wang , Lu Wang , 1 1 1 1 1 1 1 1 Liuwei Deng , Wenjun Li , Yiqi Lu , Qijun Weng , Kunyan Liu , Tao Huang , Taoying Zhou , Yufeng Jing , 1 1 5,7 3 8 9 1,2 Wei Li , Zhang Lin , Edward S Buckler , Qian Qian , Qi-Fa Zhang , Jiayang Li Bin Han . d e v r Uncovering the genetic basis of agronomic traits in crop landraces that have adapted to various agro-climatic conditions is e s important to world food security. Here we have identified ~3.6 million SNPs by sequencing 517 rice landraces and constructed e r a high-density haplotype map of the rice genome using a novel data-imputation method. We performed genome-wide association s t studies (GWAS) for 14 agronomic traits in the population of Oryza sativa indica subspecies. The loci identified through GWAS h g explained ~36% of the phenotypic variance, on average. The peak signals at six loci were tied cl