ChemOffice软件的操作与使用资料.pptVIP

化学化工软件应用技术 韩海洪 主讲 第四章 ChemOffice软件的使用 4. 1 简 介 4. 2 ChemDraw的使用 4. 3 Chem3D的使用 4. 4 ChemFinder的使用 4.1 简介 包含三大模块 1. ChemDraw模块——化学结构绘图 是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件，是国际上个论文期刊指定的格式。 2. Chem3D模块——分子构型与仿真分析 具有完整的界面及功能，提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析，并和数种量子化学软件结合在一起。 3. ChemFinder模块——化学信息搜寻整合系统 智能型的快速化学搜索引擎。可以建立化学数据库、储存及搜索，也可以使用现成的化学数据库。 4.2 ChemDraw的使用 4.2.1 概述 4.2.2 化学结构绘图 4.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 4.2.4 ChemProp-分子物理化学性质计算和标准命名 4.2.5 原子轨道和分子轨道图的制作 4.2.1 概述 ChemDraw可在Win9X/Win2000/WinXP下运行。双击，程序打开后，窗口主界面与一般Windows软件相似，依次为菜单栏、工具栏和文档区以及状态栏，工具栏提供了很多常用的化学分子及化学键。 使用时只用鼠标点一下工具栏中所需工具，移动鼠标到编辑区后，鼠标指针变为“+”，再在文档区的合适位置点击鼠标，则分子结构式就会出现，使用十分方便。 支持Windows剪贴板，所有结构式可以方便地剪贴到Word文档中，而当要修改时，只需在Word文档中双击结构式，即可打开ChemDraw进行修改。 模 板 箭头、轨道、绘图元素、括弧、化学符号、询问工具模板 氨基酸模板 芳香族、双环、生物艺术模板 玻璃仪器模板 构象异构体模板 环戊二烯、环烷模板 DNA、RNA模板 绘图实例 绘制阿司匹林结构式 4.2.2 结构绘制功能 1. 简单的无机反应式和有机分子式 ChemDraw中可以一次性输入反应式文本，在应用“Formula” 进行优化，其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增 强。 2. Fischer（费舍尔）投影式 3. Haworth（霍沃思）投影式 4. Newman（纽曼）投影式 5. 立体化学 1. Fischer（费舍尔）投影式 2. Haworth（霍沃思）投影式 3. Newman（纽曼）投影式 4.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 ChemDraw提供了核磁位移的估计计算，可以在选定分子后在Estimate菜单选择1H NMR Shift或1C-NMR Shift，相应给出分子各个H或C的位移。列表给出详细资料： 4.2.5 原子轨道图与分子轨道图的制作 ChemDraw绘制轨道的方法是使用轨道绘制工具箱，这个工具箱能够绘制s轨道、σ轨道、单瓣轨道、p轨道、杂化轨道、d轨道和dz2轨道。每种轨道都包括有三种填充类型：背景色、阴影和纯色，具体的颜色则可以自己设置。下图是一个例子： 4. 3 Chem3D的使用 整理结构与简单优化 执行【Edit】/【Select All】菜单命令，将模型全部选中； 执行【Tools】/【Clean Up Structure】菜单命令，整理 结构 执行【MM2】/【Minimize】菜单命令，弹出【Minimize Energy】对话框。 单击RUN按钮开始对模型进行优化，最终给出能量最低状态。 显示3D模型信息 将鼠标移动至3D模型的原子上，会弹出一个窗口显示该原子的相关信息； 将鼠标移动至3D模型的化学键上，会弹出一个窗口显示该化学键的相关信息，包括键长、键级等。 按住【Shift】键不动，用鼠标顺序选中连续的3个原子，然后将鼠标停留在任一个原子上，即可显示这3个原子形成的键角； 要显示更详细的信息，可执行【Analyze】/【Show Measurements】/【Show Bond Lengths】菜单命令 4.4.2 根据结构式检索 ChemFinder自带多个数据库，其扩展名为“sfw” 启动ChemFinder 打开对话框，其中包括3个选项卡，单击【Existing】选项卡 单击选中“CS_DEMO”数据库，单击“打开”按钮 根据分子式检索 根据化学名称检索 使用化学反应数据库 执行【File】/【Open】菜单命令，弹出【Open】对话框 查找到“ISICCsm”数据库，单击选中之，单击“打开”按钮出现主界面 查找免费网络资源 如果注意观察，会发现ChemFinder菜单栏上有一个【Online】菜单，可以在线查找化学信息； 该网址提供了大量的化学信息