调控一代谢网络的集成建模和分析方法的研究.pdfVIP

28卷第7期 11年7月 调控 赵 月 奚燕萍 王 飞 (上海市智能信息处理重点实验室 上海200433) (复旦大学计算机科学与技术学院上海200433) 摘 要 转录调控网络和代谢网络分别刻画了细胞新陈代谢过程的不同阶段，两个阶段相互作用，影响细胞的生命活动。调控一 代谢网络的集成建模是生物网络建模的一个重要方向，通过集成调控一代谢网络可以对整个反应体系而不是单单对代谢网络进行考 察。能够获得关于代谢和细胞功能的更全面认识，不仅有助于解释生命现象，同时对于代谢工程和合理选择药物靶标也有很大的意 义。随着大规模高通量实验技术的发展，基因组、生物化学和生理学等各方面的信息海量涌现，为重构基因组规模的系统生物学模 型提供了可能。介绍了国内外关于转录一调控网络的集成建模和分析方法，并简要评述了目前的研究现状以及可能的发展方向。 关键词 代谢网络转录调控网络基于限制的建模和分析 流量平衡分析 生物信息学 MODELINGANDANALYSISMETHoDSoF RESEARCHONINTEGRATED REGULATORY．METABoLICNETWORK ZhaoYueXi Fei YanpingWang 2D舛粥，傩i∞) (sh，l咖i研k6D嘣町矿m纠始删埘0r，Mt如n|Proc∞i增，5h，咖i (s幽“旷c0唧耐盯5c诂nce口以死曲，10锄，，u如，l踟妇H蚵，s地rlg耽i2∞4妇，蕊i№) twodi艉rent 0fthe 0f Absh鼍ct network锄dthemetabolicnetwork ch啪cterize regulatory respectively stages process ne仃anscriptional ceUmetabolism．Thetwo interact“t}Ieacho山ertoinfluenceceUlifeactivities． ofthe net— 8tages modeling Inte铲ated workisan in network canbe瑚de direction networks，inVestigations import明t biolo舀cal modelillg．Byintegratingt瑚mscriptional-regulatory overt}Ie of network．More about ceUfunctionsc蛐 ent№弛nectioninstead metaboly粕d system ju8t凼eregulatory comprehensiveknowledge