kiyik河胡杨内生细菌多样性分析及一株潜___在新种的多相分类学鉴定本科生毕业设计论文.docVIP

新疆大学硕士毕业论文 PAGE PAGE 12 硕士研究生学位论文 新 疆 大 学 论文题目（中文）：Kiyik河胡杨内生细菌多样性分析及一株潜在新种的多相分类学鉴定 论文题目（外文）：Diversity of Endophytic Bacteria from the Populus euphratica in kiyik ancient river and taxonomic identification of a novel bacterium 研 究 生 姓 名：布阿依夏姆·阿木提 学 科 专 业：生 物 学 研 究 方 向：微生物学 导师 姓名 职称：艾尔肯·热合曼 教授 论文答辩日期 2013年5 月 24 日 学位授予日期 年 月 日 Magisterial Thesis Diversity of Endophytic Bacteria from the Populus euphratica in kiyik ancient river and taxonomic identification of a novel bacterium Master Degree Candidate: Buayshem Hamood Mentor: Prof. Erkin Rahman College of Life Science and Technology, Xinjiang University 摘 要 本研究对位于塔里木河中游废弃343年的古河道胡杨林胡杨茎秆液进行可培养内生细菌的多样性分析。三颗胡杨茎秆液混合之后采用常规培养法分离得到80株纯培养物。其中25株从LB培养基，21株从NB培养基，16株从KB培养基而18株从MA培养基所分离到的。有32株杆状，45株短杆状和3株球状，17株革兰氏阳性，63株革兰氏阴性细菌。表型特征和16S rRNA基因序列系统发育分析结果显示，80株菌归类为厚壁菌门（Firmicutes）、 HYPERLINK /wiki/%E6%94%BE%E7%B7%9A%E8%8F%8C%E9%96%80 \o 放線菌門 放线菌门（Actinobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）等5个类群，16个属，24个种。其中属于γ-变形菌的细菌为49株，占分离菌株的61.25%（49/80）；属于厚壁菌门的细菌为15株，占分离菌株的18.75%（15/80）；属于α-变形菌纲的细菌为10株，占分离菌株的12.5%（10/80）；属于放线菌门的细菌为7株，占分离菌株的8.75%（7/80）；属于拟杆菌门的细菌为1株，占分离菌株的 1.25%（1/80）。假单胞菌属(Pseudomonas)是占优势属，占分离菌株的43.75% (35/80)。 在80株细菌当中发现与Pseudomonas xinjiangensis、Pseudomonas sabulinigri、Pseudomonas azotifigens、Pseudomonas pelagia、Rhizobium rosettiformans、Microbacterium hydrocarbonoxydans、Microbacterium sedminis 、Halomonas sulfidaeris、Halomonas meridiana、Halomonas desiderata、Nesterenkonia aethiopica、Nesterenkonia suensis 、Nocardioides alkalitolerans、Planococcus maritimus、Pontibacter salisaro、Planomicrobium koreense和 Pantoea brenneri等模式菌株有着低于98.7%的16S RNA基因序列相似性的59株细菌。初步认为是14种潜在新分类单元，需对其进行进一步研究。 对潜在新种的详细多相分类学研究结果表明，菌株KBL-4-9是短杆状，无鞭毛，严格好氧，细胞内积累类脂粒（PHB，即poly-β-hydroxybutyric acid 聚-β-羟基丁酸）的革兰氏阴性菌株。生长温度是4-45℃（最适37℃），pH范围是6.0-9.0（最适pH 7.0），NaCl浓度范围是0-3%（w/v）（最适是0-1%）。 与Pseudomonas xinjiangensis S3-3T有97.24%的16S rRNA基因序列相似性和41.2%的DNA-DNA杂交率。基因组D