dd结直肠癌肝转移负相关基因SPARCL1的发现和功能的研究.pptVIP

研究背景 大肠癌是常见的恶性肿瘤之一 －－发病率 3～5位 －－死亡率 4～5位 大肠癌肝转移 －－ 治疗失败的主要原因之一 肝脏－－远处转移的最主要转移部位 预后较差，中位生存期为5～10个月 大肠癌死亡病人（尸检） 可发现36％～81％的肝转移 研究目的 寻找肿瘤转移相关标志物 原发灶与转移灶特性相似 转移决定于原发灶 通过比较伴肝转移和无转移的肠癌原发灶来寻找转移相关基因 材料与方法 GSEA： Gene Set Enrichment Analysis，基因富集分析方法 一种生物信息学方法，用来确定一组预先定义的基因在两组表型不同的样本间是否有表达差异。 预定义的基因：如属于同一Pathway的基因, 定位于同一Cytoband的基因 本研究中用来发现基因表达存在差异表达的染色体区带 基因表达谱数据的GSEA分析表明： 4q22为肠癌肝转移相关染色体显带，所包含的基因在无转移和伴肝转移肠癌间表达差异显著 SPARCL1基因为4q22中最重要的基因（权重最高） SPARCL1基本情况 定位于人类染色体4q22，基因大小为35 kb，由11个外显子和 10个内含子组成 mRNA长度是3 kb，编码664个氨基酸，蛋白质分子量约为 71 kDa，存在多个糖基化位点 分泌型的基质细胞糖蛋白，参与多项机体生理过程，如细胞