玉米淀粉合成相关基因ZmSSIIa的序列变异分析.pdfVIP

科技导报2014，32（36） 玉米淀粉合成相关基因玉米淀粉合成相关基因ZmSSIIaZmSSIIa的的 序列变异分析序列变异分析 杨泽峰，张恩盈，杜灿灿，马思佳，胡芸芸，谢政文，潘亮，陈庆，徐辰武 扬州大学农学院；教育部植物功能基因组学重点实验室；江苏省作物遗传生理重点实验室，扬州225009 摘要摘要 玉米淀粉合成酶ZmSSIIa在淀粉生物合成途径中主要作用是将支链淀粉的分支链由6~10个延长至12~25个，对于玉米 籽粒产量和品质具有重要的影响。本研究在86个优异玉米自交系中对该基因进行基因序列定点捕获，并获得该基因全长为 4836 bp的核苷酸序列。基因多态性分析发现，该基因座位上有78个SNP和19个Indel。玉米ZmSSIIa基因的编码区具有24 个SNP，将该基因划分成9种编码区单倍型，并编码7种ZmSSIIa蛋白质。供试材料的群体中，ZmSSIIa基因至少经历8次重 组，可能对单倍型的分化和连锁不平衡具有重要作用。中性进化测试表明该基因在供试群体中没有明显的人工选择。 关键词关键词 玉米；ZmSSIIa基因；序列多态性；单倍型；连锁不平衡 中图分类号中图分类号 Q943.2