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临床蛋白质组学疾病蛋白质组学 重庆医科大学基础医学院 冯 涛 复杂性科学—21世纪的科学 整体大于其组成部分之和 系统具有层次结构和功能结构 系统处于不断发展之中 系统经常与其环境(外界)有物质、能量和信息的交换 系统在远离平衡的状态下也可以稳定(自组织) 确定性的系统有其内在的随机性(混沌) 而随机性的系统又有其内在的确定性(突现) 这些新的发现不断冲击着经典科学的传统观念。 系统论、信息论、控制论、相变论、耗散结构论、突变论、协同论、混沌论、超循环论、等新科学理论也相继诞生。这种趋势使许多科学家感到困惑,也促使一些有远见的科学家开始思考并探索新的道路。复杂系统和系统的复杂性就是在这样的背景下提出的。 复杂系统 复杂系统涉及的范围很广 自然 工程 生物 经济 管理 政治 社会 复杂现象从一个细胞呈现出来的生命现象,到股票市场的涨落、城市交通的管理、自然灾害的预测,乃至社会的兴衰等,目前,关于复杂性的研究受到了世界各国科学家们的广泛关注。1999年,美国《科学》杂志出版了一期以“复杂系统”为主题的专辑,这个专辑分别就化学、生物学、神经学、动物学、自然地理、气候学、经济学等领域中的复杂性研究进行了报道。由于各学科对复杂性的认识和理解都不一样,所以该专辑避开术语上的争论,采用了“复杂系统”这个名词。 复杂系统都有一些共同的特点,就是在变化无常的活动背后,呈现出某种捉摸不定的秩序,其中演化、涌现、自组织、自适应、自相似被认为是复杂系统的共同特征。 复杂性科学 复杂性科学是研究复杂性和复杂系统的科学。 采用还原论与整体论相结合的方法研究复杂系统中各组成部分之间相互作用所涌现出的特性与规律,探索并掌握各种复杂系统的活动原理,提高解决大问题的能力。 复杂性科学的应用范围很广,涉及自然科学和社会科学多个方面,是典型的大跨度交叉领域,需要融合多方面的知识开展综合集成研究。 经典科学的认识论基础是简化论、还原论。当一个复杂问题难以把握或处理时,就把它“拆整为零”,划分为若干个局部,逐个解决每个局部问题,然后再“聚零为整”,将各个局部问题的答案拼合成原问题的所求的答案。经典科学认为总体就等于部分之和。 现代科学越来越要求人们从整体思维的角度去观察和分析问题。 复杂性科学有三个主要特点 研究对象是复杂系统; 研究方法是定性判断与定量计算相结合,微观分析与宏观分析相结合,还原论与整体论相结合,科学推理与哲学思辩相结合; 研究深度不限于对客观事物的描述,而是着重于揭示客观事物构成的原因及其演化的历程,并力图尽可能准确地预测其未来的发展。 经典科学在思想方法上的主要偏颇在于形而上学的还原论的严重影响,即片面地强调分解,而在相当大的程度上忽视了综合。 片面性主要表现在以下四个方面。 第一,忽视了整体性,认为只要掌握了各个局部,整体自然而然地就清楚了。亚里士多德曾说过:“整体大于它的各部分之和。”即在若干部分组成一个整体时,除了各部分自身的各种属性之外,还产生了新的质。而经典科学则忘记了或者忽视了这个道理。 第二,片面强调量变,而忽视了质变,甚至认为一切质变都可以归结为量的变化,在事实上否认了质变。 第三,否认层次之间的质的差别,以为目前人类已经认识的局部规律可以在任何层次上适用,例如,牛顿力学、连续的概念等。 第四,用静止的观点看待事物,不承认世界有真正的发展、真正的变化,顶多承认循环和重复。 疾病蛋白质组学disease proteomics 运用蛋白质组学研究手段,通过比较正常和病理情况下细胞、组织或体液中蛋白质在组成成分、表达水平、表达位置和修饰状态上的差异,寻找疾病诊断和预后的特异性蛋白质(群),包括特异性抗原及相关抗原、受体、酶等,以及药物治疗的靶标等。通过深入了解这些疾病特异性蛋白质的结构和功能,揭示疾病过程中细胞内全部蛋白质的活动规律,为多种疾病发生、发展机制的阐明和早期诊断及治疗提供理论根据和解决途径。 蛋白质和健康------- 没有蛋白质就没有生命 蛋白质是生物体内一种极重要的高分子有机物,占人体干重的54%。蛋白质主要由氨基酸组成,因氨基酸的组合排列不同而组成各种类型的蛋白质。人体中估计有10万种以上的蛋白质。生命是物质运动的高级形式,这种运动方式是通过蛋白质来实现的,所以蛋白质有极其重要的生物学意义。人体的生长、发育、运动、遗传、繁殖等一切生命活动都离不开蛋白质。生命运动需要蛋白质,也离不开蛋白质。 胺类、神经递质、多肽类激素、抗体、酶、核蛋白以及细胞膜上、血液中起“载体”作用的蛋白都离不开蛋白质,它对调节生理功能,维持新陈代谢起着极其重要的作用。人体运动
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