4遗传标记说课.pptVIP

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一、基因型频率计算 基因型频率(genotype frequency):在一个群体中,某基因座上不同基因型在全部个体中所占的百分比。根据等位基因频率计算。 例:MN系统:M=0.526;N=0.474 MM=M=0.526×0.526=0.2767 MN=2MN=2×0.526×0.474=0.4986 NN=N=0.474×0.474=0.2247 二、基因频率计算 基因频率(gene frequency):在一个群体中,某基因座上不同等位基因在全部个体中所占的百分比。 1.???? 计数法 基因频率=某基因座特定等位基因数/某基因座所有等位基因数 例:MN系统:1000个体 MM有372个,MN有496个,NN有132个 等位基因数为2000个 M(等位基因数)=2MM+MN=2×372+496=1240 M(基因频率)=2MM+MN/2000=0.62 P(A)=2×AA+AB/2×个体总数 Q(B)=2×BB+AB/2×个体总数 多个等位基因: P(A)=2×AA+AB+AC+AD /2×个体总数 三、Hardy-Weinberg定律:在一个无限大的、不发生突变、迁移和选择并随机交配的群体中,基因频率和基因型频率在世代传递中保持不变,处于平衡状态。 一、??? 杂合度计算 杂合度(heterozygosity)某群体某一遗传 标记所有基因型中杂合子所占 的比例。 h=杂合子数/个体总数 一、???? 个人识别能力 个人识别能力(power of discrimination,DP)在同一群体中随机抽取 两名个体,其基因型不同的概率,即遗传标记可 以识别无关个体的能力。 n DP=1-Pm=1-ΣPi2 J=1 n为某遗传标记的基因型数目。 Pi为该群体第I个基因型的频率。 n ΣPi2为群体中随机抽取两名个体,基因型由于机会而一致的概率。 J=1 也称作随机匹配概率(probability of matching,Pm)累计个人识别能力 TDP=1-(1-DP1)(1-DP2)(1-DP3)(1-DPk) =1- Pm1×Pm2×Pm3×Pm4×Pm5×Pmk k 1-???? ΣPj j-1 似然率(likelihood,LR)某种表型组合频率的倒数,即:随机匹配概率。 例:TPOX 8-11 0.328 0.323 D3S1358 15-16 0.242 0.078 FGA 22-23 0.103 0.008 D5S818 11-12 0.154 0.0012 CSF1PO 11-12 0.190 0.00023 D7S820 11-12 0.143 0.000033 D8S1179 13-14 0.075 0.0000025 THO1 7-9 0.294 0.000000074 VWA 14-17 0.131 0.0000000097 D13S317 8-11 0.105

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