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DNA和RNA提取方法及原理 和 提取方法及原理 DNA提取专题 DNA提取专题第一部分: 第一部分:DNA提取方法简介 提取方法简介 第二部分: 第二部分:DNA提取常见问题分析及对策 提取常见问题分析及对策 前言 DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物 是遗传信息的载体, 是遗传信息的载体 信息分子,是分子生物学研究的主要对象。 信息分子,是分子生物学研究的主要对象。为 了进行测序、杂交和基因的表达,获得高分子 了进行测序、杂交和基因的表达, 量和高纯度的DNA是非常重要的前提。 是非常重要的前提。 量和高纯度的 是非常重要的前提 DNA提取原则 DNA提取原则保证DNA结构的完整性 纯化后不应存在对酶有抑制作用的物质 排除有机溶剂和金属离子的污染 蛋白质、多糖、脂类等降低到最低程度 排除其他核酸分子的污染 DNA提取的几种方法 DNA提取的几种方法染色体DNA的提取 染色体DNA的提取 DNA CTAB法 法 SDS法 SDS法 其它 DNA提取的几种方法 DNA提取的几种方法非染色体DNA的提取 的提取 非染色体 质粒DNA的提取 的提取 质粒 ? 碱裂解法 ? 煮沸法 线粒体、叶绿体 线粒体、叶绿体DNA的提取 的提取 ? 差速离心结合 差速离心结合SDS裂解法 裂解法 基因组DNA- CTAB法 基因组DNA- CTAB法 CTAB法原理(植物 提取经典方法) 法原理 植物DNA提取经典方法 提取经典方法) CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基 ( , 溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜, ),是一种阳离子去污剂 溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合 物。 该复合物在高盐溶液中( 该复合物在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,通过有机溶剂 )是可溶的, 抽提,去除蛋白、多糖、 抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离 出来。 出来。 溶液在低于15 时会形成沉淀析出, 注:CTAB溶液在低于 时会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的 溶液在低于 植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于 植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15。 基因组DNA- CTAB法 基因组DNA- CTAB法 CTAB提取缓冲液的经典配方 提取缓冲液的经典配方 Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏; )提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏; EDTA螯合 2+或Mn2+离子,抑制 螯合Mg 离子,抑制DNase活性; 活性; 螯合 活性 NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中; 提供一个高盐环境, DNP充分溶解 存在于液相中; 充分溶解, CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离; 溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离; 溶解细胞膜 β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除 巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变, 巯基乙醇是抗氧化剂 CTAB提取缓冲液的改进配方 提取缓冲液的改进配方 PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合 (聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物, 物质,有效去除多酚,减少 中酚的污染; 物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合, 中酚的污染 同时它也能和多糖结合, 有效去除多糖。 有效去除多糖。 基因组DNA- CTAB法 基因组DNA- CTAB法 CTAB法流程图 法流程图植物材料 裂解液酒精沉淀 液氮研磨 抽提 离心洗涤 DNA溶液 溶液 细胞裂解 上层溶液 干燥溶解 基因组DNA-SDS法 基因组DNA-SDS法 SDS法原理 法原理 SDS是一种阴离子去垢剂, 在高温 ( 55~65) 条件下能裂解细 是一种阴离子去垢剂,在高温( ~ 是一种阴离子去垢剂 使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸; 胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸; 提高盐(KAc或NH4Ac)浓度并降低温度(冰浴),使蛋白质及多糖 或 浓度并降低温度( 提高盐 浓度并降低温度 冰浴) 杂质沉淀,离心后除去沉淀; 杂质沉淀,离心后除去沉淀; 上清液中的DNA用酚 氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的 用酚/氯仿抽提 上清液中的 用酚 氯仿抽提, DNA。 。 基因组DNA-SDS法 基因组DNA-SDS法 SDS法流程图 以动物组织为例) SDS法流程图 (以动物组织为例)动物组织抽提 离心洗涤 组织匀浆 上层溶液 干燥溶解 细胞裂解 酒精沉淀 DNA溶液 溶液 基因组DNA- 基因组DNA-其它方法根据细胞裂解方式的不同有: 根据细胞裂解方式的不同有:物理方式:玻璃珠法、超声
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