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1.4势能面
1.4势能面
本章第一节中已经提到,出现在方程(1.1.5)和(1.1.14)中的被称为势能面. 在(1.1.5)式中,它是电子运动的能量,由于电子态的能量与核构型有关,因此是核坐标的函数. 在(1.1.14)式中,它是原子核运动的势能函数. 只依赖于分子内部各原子的相对位置,而与分子整体的平动和转动(注意,不是分子内旋转!)无关,即在中不包含分子整体的平动和转动坐标,这一点在双原子分子问题中已经显示出来. 在双原子分子中,势函数仅是核间距的函数. 对于原子分子体系,共有个核位置坐标,将平动坐标和转动坐标去掉后,势函数只包含()(非线性分子)或()(线性分子)个内坐标(键长,键角,二面角等).
从几何上看,势函数是由()/()个坐标张成的空间中的一个超曲面,因此被称为势能面。势能面在量子化学,分子光谱,分子反应动力学和分子力学模拟中占有十分重要的地位. 建造性能优良的势能面是量子化学计算的目标,同时又是动力学计算的起点.
势能面大体上可以分为三类. 一类是从头算势能面. 这类势能面的建造方法是,先求解方程(1.1.5),得到不同核构型下的电子态能量,它们相当于势能面上的一个个单点,通常要计算几千乃至几万个单点,然后设计适当的解析函数,其中含有若干个参量,用该解析函数拟合计算得到的单点,用最小二乘法确定其中的参量,从而得到势能面的解析表达式. 如此建造的势能面的质量取决于单点的计算精度,单点的布局,解析函数的形式是否合适等因素. 由于这种势能面是通过解Schr?dinger方程得到的,它直接来自第一原理,因此被称为从头算势能面.
另一类是经验势能面. 人们根据经验,选定势能面的函数形式,其中包含一系列参数,然后根据光谱数据或其它实验数据确定参数值,从而得到势能面的解析表达式. 这种方法不需要求解电子运动的Schr?dinger方程,从而大大简化了计算. 但是这种势能面依赖于经验,其建造过程带有一定的盲目性.
介于以上两类之间的是半经验势能面. 这类势能面的建造方法通常是将计算结果与实验值比对,以确定势函数中的参量,既需要理论计算,也需要实验资料.
分子动力学模拟的基础是分子力场. 由于势函数梯度的负值是力,而分子动力学模拟中通常解牛顿方程,涉及到原子、分子的受力问题,因此在分子动力学模拟中把势能函数(势能面)叫做力场.
分子动力学模拟中所用的势函数大多为经验或者半经验势函数. 为了使势函数符合化学概念并具有较为明确的物理图像,一般把势函数分解为如下一些项的加和:
势能=键伸缩势能+键角弯曲势能+二面角扭曲势能+离平面振动势能+范德华作用势能+库仑作用势能+氢键作用势能
(1.4.1)
键伸缩势能描述两个成键原子间的相互作用. 对于稳定分子来说,各原子在其平衡位置附近做微小振动,因此,原子间的键长并非维持恒定,而是在其平衡值附近做小幅变动. 最简单的方法是将取为谐振子势,即
(1.4.2)
式中,为第个化学键的力常数, 和分别为第个键长的即时值和平衡值,愈大,振动频率愈大.
键角弯曲势能描述由于键角变化引起的能量变化. 分子中连续键连的三原子形成键角. 与键的伸缩一样,这些键角也并非维持恒定不变,而是在其平衡值附近做小幅变动. 的最简单形式类似于谐振子势,即
(1.4.3)
式中,为键角弯曲的弹力常数,和分别为第个键角的即时值和平衡值.
二面角扭曲势能描述由于二面角变化引起的能量变化. 分子中连续键连的四个原子形成二面角(dihedral),一般说来,二面角较易于扭曲(torsion), 的最简单形式可取为
(1.4.4)
式中,为第个二面角扭曲的弹力常数,和分别为第个二面角的即时值和平衡值.
有些分子中会出现四个以上的原子共平面的情况. 例如,在平衡位置时丙酮中的三个碳原子与氧原子共平面. 通常共平面的四个原子的中心原子(如的中心碳原子)在平面上下做小幅振动. 这种振动引起的能量变化称为离平面振动势(out-of-plane bending energy). 它的最简单形式可取为
(1.4.5)
式中,为离平面振动的弹力常数,为中心原子偏离平面的距离.
当两个原子属于同一分子但其间隔多于两个化学键(如),或者两原子分属不同分子时,则该原子对间有范德华(van der Waals)相互作用. 因此范德华作用是一种非键相互作用. 可以用Lenard-Jones(LJ)势(又称为12-6势)来描述范德华相互作用,即
(1.4.6
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