NCBI所有数据库简介详解.docxVIP

美国国家生物技术信息中心 (National Center of Biotechnology Information) 唐志立 它的使命包括四项任务： 1. 建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统 2. 实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究 3. 加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 4. 全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。 文献 Literature 书库 Books NCBI的书库不断收集生物医学方面的书籍，提供这些书籍的出版信息，摘要，目录和全文的链接，用户可以直接在检索文本框输入一个观念就可以查询。 医学主题词表 MeSH Medical Subject Headings)是NLM美国国家医学图书馆为PubMed用于索引文章。控制词汇的同义词典/link?url=agQ4kAJ3_2rYUuE02sR56wgn5PQjeRUDw5K0JT_acSlA7tk6E-JkxH-o5xLFgMz5_O4n0H01IzprV77l9rBnQK 美国国家医学图书馆目录 NLM Catalog NLM Catalog为藏书超过130万册的美国国立卫生图书馆(NLM)记录设立目录信息，包括杂志、图书、手稿、计算机软件、录音文件和其它电子资源。每一条记录都可链接到NLM LocatorPlus和具有相近题目或MeSH词汇的相关文件目录信息。 PubMed PubMed PubMed 是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。 公共医学中心 PubMed Central PubMed Central (PMC) 是美国国立卫生研究院提供的一项服务,存档生物医学,生命科学科研文献,PMC获得NLM(National Library of Medicine)的授权,收录存档生物/医学文献,以电子副本的形式储存.PMC与2000年2月份启动,目前由NCBI(NLMs National Center for Biotechnology Information )负责开发与维护. 基因 Genes 表达序列标记 EST EST(Expressed Sequence Tags)：EST数据库收录了GenBank EST中的所有数据和没有生物学注释信息的“单分子识别首次通过(first-pass single-read)”的cDNA序列。EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列，代表一个完整基因的一小部分，在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等，平均长度为360 ±120bp。EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库，因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。 基因 Gene Gene数据库为用户提供基因序列注释和检索服务，还会链接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer、Model Maker、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved Domain Database(CDD)等数据库资源以及其它与基因相关的资源。Entrez Gene数据库收录了来自5300多个物种的430万条基因记录。 基因表达文库数据集 GEO DataSets Gene Expression OmnibusDataSetsGEO DataSets 储存由 Gene Expression Omnibus (GEO) repository（资源库）中得来的基因表达以及分子丰富性的数据。GEO DataSets: GEO数据库(收录整个试验的数据) 基因表达文库概况 GEO Profiles GEO Profiles 储存单独的由 Gene Expression Omnibus (GEO) repository中得来的基因表达以及分子丰富性的数据。GEO Profiles数据库 (它负责收录一个基因在一次试验中的定量基因表达数据) HomoloGene HomoloGene HomoloGene数据库是一个在20种完全测序的真核生物基因组中自动检索同源基因的系统，包括直系同源与旁系同源。HomoloGene的结果报告包括基因同源性和来自OMIM、小鼠基因组信息学(Mouse Genome Informatics, MGI)、斑马鱼信息网络(Zebrafish Information Network, ZFIN)、酵母基因组数据库(Saccharomyces Genome Database, SGD)、直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups，COG)