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密码子表
表一:密码子表
此表列出了64种密码子以及氨基酸的标准配对。 第二位碱基 U C A G 第一位碱基 U UUU (Phe/F)苯丙氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UUG (Leu/L)亮氨酸 UCU (Ser/S)丝氨酸UCC (Ser/S)丝氨酸UCA (Ser/S)丝氨酸UCG (Ser/S)丝氨酸 UAU (Tyr/Y)酪氨酸UAC (Tyr/Y)酪氨酸UAA 终止UAG 终止 UGU (Cys/C)半胱氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UGA 终止UGG (Trp/W)色氨酸 C CUU (Leu/L)亮氨酸CUC (Leu/L)亮氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸CUG (Leu/L)亮氨酸 CCU (Pro/P)脯氨酸CCC (Pro/P)脯氨酸CCA (Pro/P)脯氨酸CCG (Pro/P)脯氨酸 CAU (His/H)组氨酸CAC (His/H)组氨酸CAA (Gln/Q)谷氨酰胺CAG (Gln/Q)谷氨酰胺 CGU (Arg/R)精氨酸CGC (Arg/R)精氨酸CGA (Arg/R)精氨酸CGG (Arg/R)精氨酸 A AUU (Ile/I)异亮氨酸AUC (Ile/I)异亮氨酸AUA (Ile/I)异亮氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸, 起始1 ACU (Thr/T)苏氨酸ACC (Thr/T)苏氨酸ACA (Thr/T)苏氨酸ACG (Thr/T)苏氨酸 AAU (Asn/N)天冬酰胺AAC (Asn/N)天冬酰胺AAA (Lys/K)赖氨酸AAG (Lys/K)赖氨酸 AGU (Ser/S)丝氨酸AGC (Ser/S)丝氨酸AGA (Arg/R)精氨酸AGG (Arg/R)精氨酸 G GUU (Val/V)缬氨酸GUC (Val/V)缬氨酸GUA (Val/V)缬氨酸GUG (Val/V)缬氨酸 GCU (Ala/A)丙氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GCG (Ala/A)丙氨酸 GAU (Asp/D)天冬氨酸GAC (Asp/D)天冬氨酸GAA (Glu/E)谷氨酸GAG (Glu/E)谷氨酸 GGU (Gly/G)甘氨酸GGC (Gly/G)甘氨酸GGA (Gly/G)甘氨酸GGG (Gly/G)甘氨酸 Ala A GCU, GCC, GCA, GCG Leu L UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG Arg R CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG Lys K AAA, AAG Asn N AAU, AAC Met M AUG Asp D GAU, GAC Phe F UUU, UUC Cys C UGU, UGC Pro P CCU, CCC, CCA, CCG Gln Q CAA, CAG Ser S UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC Glu E GAA, GAG Thr T ACU, ACC, ACA, ACG Gly G GGU, GGC, GGA, GGG Trp W UGG His H CAU, CAC Tyr Y UAU, UAC Ile I AUU, AUC, AUA Val V GUU, GUC, GUA, GUG 起始 AUG 终止 UAG, UGA, UAA 起始和终止密码子
蛋白质的转译从初始化密码子(起始密码子)开始,但亦需要适当的初始化序列和起始因子才能使mRNA和核糖体结合。最常见的起始密码子为AUG,其同时编码的氨基酸在细菌为甲酰甲硫氨酸,在真核生物为甲硫氨酸,但在个别情况其它一些密码子也具有起始的功能。
在经典遗传学中,终止密码子各有名称:UAG为琥珀(amber),UGA为蛋白石(opal),UAA为赭石(ochre)。这些名称来源于最初发现到这些终止密码子的基因的名称。终止密码子使核糖体和释放因子结合,使多肽从核糖体分离而结束转译的程序。另外,在哺乳动物的线粒体中,AGA和AGG也充当终止密码子。
[编辑] 简并性
大部分密码子具有简并性,即两个或者多个密码子编码同一氨基酸。简并的密码子通常只有第三位碱基不同,例如,GAA和GAG都编码谷氨酰胺。如果不管密码子的第三位为哪种核苷酸,都编码同一种氨基酸,则称之为四重简并;如果第三位有四种可能的核苷酸之中的两种,而且编码同一种氨基酸,则称之为二重简并,一般第三位上两种等价的核苷酸同为嘌呤(A/G)或者嘧啶(C/T)。只有两种氨基酸仅由一个密码子编码,一个是甲硫氨酸,由AUG编码,同时也是起始密码子;另一个是色氨酸,由UGG编码。
遗传密码
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